除了用基因作探針直接檢測基因內(nèi)的核苷酸變化引起的RFLP外，還有兩種途徑：一是用基因作探針，檢測該基因兩側(cè)順序中核苷酸變化引起的RFLP，確定這些RFLP與遺傳病之間有無連鎖關(guān)系。另一種是用克隆的專一DNA順序作探針，檢測基因兩側(cè)順序DNA的RFLP與遺傳病的連鎖關(guān)系。迄今用上述三種方法已查明近30種遺傳病可通過RFLP來檢測。表23-5、6、7為部位舉例。
表23-5 用基因作探針檢測基因內(nèi)的結(jié)構(gòu)變化來直接分析遺傳病
| 遺傳病 | 探針 | 年代 |
| 抗凝血酶Ⅲ缺乏癥 | 抗凝血酶Ⅲ基因 | 1983 |
| α1抗胰蛋白酶缺乏癥 | 合成的寡核苷酸 | 1983 |
| 動脈粥樣硬化癥 | 載脂蛋白A-基因 | 1983 |
| 糖尿病 | 胰島素基因 | 1983 |
| Ehlers-Danlos綜合癥 | α（1)膠原蛋白基因 | 1983 |
| 生長激素缺乏癥 | 生長激素基因 | 1981 |
| 乙型血友病 | 凝血因子ⅠⅩ基因 | 1983 |
| 遺傳性胎兒血紅蛋白持存癥 | β珠蛋白基因 | 1979，1983 |
| HPRT缺乏癥 | HPRT基因 | 1983 |
| 自毀容貌綜合征 | HPRT基因 | 1983 |
| 成骨不全 | 原α1（1)膠原蛋白基因 | 1983 |
| 視網(wǎng)膜母細胞瘤 | Rb基因 | 1983 |
| 鐮形細胞貧血 | 合成的寡核苷酸 | 1983 |
| 地中海貧血 | β珠蛋白基因 | 1981 |
| α和β珠蛋白基因 | 1978，1980 | |
| 甲型血友病 | 凝血因子Ⅷ基因 | 1985 |
表23-6 用克隆的DNA片段作探針檢測連鎖的RFIP間接分析遺傳病
|
遺 傳 病 |
探 針 |
探針與疾病基因座位間距離（cm)* |
年 代 |
| 脆性X綜合征 | PN1，VK21，U6-2 |
＜5 |
1989 |
| 慢性進行性舞蹈病 | G8 |
＜10 |
1983 |
| Menkes鋼發(fā)癥 | L1，28 |
16 |
1983 |
| 肌營養(yǎng)不良 | |||
| 良性假肥大型 | XJ和per+87系列 |
?/FONT> |
1983 |
| 假肥大型 | XJ和per+87系列 |
?/FONT> |
1986 |
| 強直性肌營養(yǎng)不良 | 補體C3基因 |
7 |
1983 |
| 類固醇-硫酸酯酶-X鏈鎖甲癬 | λRC8 |
25 |
1983 |
| 視網(wǎng)膜劈裂癥（Retinoschisis) | λRC8 |
15 |
1983 |
表23-7 用基因作探針檢測緊密連鎖的RFLP間接分析遺傳病
| 遺傳病 | 基因探針 | 年代 |
| 糖尿�。á蛐�) | 胰島素基因 | 1981，1983 |
| 生長激素缺乏癥（Ⅰ型) | 生長激素基因 | 1982 |
| 高甘油三酯血癥 | 載脂蛋白A-1基因 | 1983 |
| 苯酮尿癥 | 苯丙氨酸羥化酶基因 | 1983 |
除了遺傳病與RFLP之間的關(guān)系的資料，還發(fā)現(xiàn)人體癌基因Ha-ras的Bam HI片段的長度可在6.75～8.7kb之間變動。這種RFLP是由于Ha –ras基因有一段可變串聯(lián)重復(fù)順序（vari-able tandem replication,VTR)。重復(fù)順序長28bp、重復(fù)次數(shù)可以不同，所以造成BamHⅠ片段的長度變化。圖23-9中左圖箭頭是某種酶的切點，黑框代表可變串聯(lián)重復(fù)順序。右圖代表某種酶切割后，不同個體顯示的電泳圖譜。1/1、2/2、3/3代表1、2、3等位基因的純合子；1/2、1/2、2/3代表三種可能的雜合子，由于重復(fù)順序數(shù)目不同改變了該酶的切點位置，因而形成不同長度的DNA片段。除Ha-ras癌基因外，成人多囊腎（adult polycystic kidney)基因旁也出現(xiàn)VTR，現(xiàn)已用它作攜帶者及產(chǎn)前診斷。
圖23-9 可變串聯(lián)重復(fù)順序（VTR)示意圖
