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DNA及寡核苷酸探針在原位雜交組織化學(xué)中的應(yīng)用

 

  (4)雜交后漂洗

  ①在每管中加入1.25ml 50%甲酰胺-2×SSC(pH7.0),在42℃靜置10~15min。偶爾旋轉(zhuǎn)以助混勻。冷卻至室溫。加100μl經(jīng)dimethylsuberimidate(DEMS)處理的血細(xì)胞(107/ml)混勻,離心,室溫,10min,輕彈試管使沉淀的小塊散開(kāi),加入1.25ml 2×SSC(pH7.0),42℃,繼之,靜置于室溫10~15min,如前離心,再加1.25ml IBM-Triton X-100,室溫靜置5min,離心。

  注:DEMS處理紅細(xì)胞方法:經(jīng)漂洗并離心去除白細(xì)胞和血清的紅細(xì)胞在鹽液如PBS中,細(xì)胞含量為108/ml,以K2CO3和DEMS溶液處理3次,第1次:K2CO3為20mmol/L,DEMS為3mmol/L,以后2次:K2CO3依然為20mmol/L,而DEMS為10mmol/L。在應(yīng)用前將K2CO3和DEMS液混合加入紅細(xì)胞混懸液中。在最后2次漂洗液中,應(yīng)用100mmol/l K2CO3將pH調(diào)至9~10。在25℃,15min后,加入50μl,100mmol/l 的檸檬酸(citric acid)/每ml細(xì)胞混懸液的濃度以達(dá)固定紅細(xì)胞的目的。固定的紅細(xì)胞離心傾去上清液后,用2×SSC稀釋到108/ml,加0.1%疊氮鈉可在4℃保存至少1年。

  (5)AFF標(biāo)記的熒光顯示:加200μl的PBS含0.05%Tween和2%正常血清(NGS),輕輕振蕩混勻,室溫靜置10min,加20μl 1:100的單克隆抗AFF抗體,37℃孵育45min,加1.25ml的PBS-Tween,室溫靜置10min,加20間歇性振蕩,離心,傾去上清液,加200μlPBS含0.05%Tween –2%NGS,振蕩,室溫靜置10min,加20μl的羊抗小鼠–FITC熒光標(biāo)記抗血清,稀釋度1:100~1:300。孵育于37℃45min,加1.25ml PBS –Tween,室溫靜置10min,離心,傾去上清液。

  (6)生物素標(biāo)記探針的熒光顯示:加200μl 4×SSC含0.1%Trion X-100 和5%BSA。室溫靜置10min后,加20μl抗生物素標(biāo)記FITC抗血清15μg/ml,孵育在37℃30min,以1.5ml 4×SSc –0.1% Trion X-100洗1次,加入1.25ml IBm –Triton X-100,室溫靜置10~15min,間歇振蕩、離心。

 。7)熒光顯微鏡觀察:將細(xì)胞核混懸液稀釋于250μl的IBM-Trion X-100中,輕加振蕩混勻。為抗熒光褪色可加等量的抗褪色溶液至載片上的細(xì)胞核涂片上,選擇適當(dāng)?shù)募ぐl(fā)波長(zhǎng)觀察。

 。8)流式細(xì)胞計(jì):將750μl的細(xì)胞核混懸液通過(guò)流式細(xì)胞儀(Flow cytometry, FCM),DEMS處理過(guò)的紅細(xì)胞作為對(duì)照(Df 530/30nm, Omega ·Optical Inc, Brattleboro, VT)。詳細(xì)操作見(jiàn)第十章 。

  二、寡核苷酸探針的應(yīng)用

  寡核苷酸探針的優(yōu)點(diǎn)在于它能根據(jù)需要人工用DNA合成儀合成,其長(zhǎng)度及分子大小比較一致,可以控制。其長(zhǎng)度一般較克隆的DNA片段短。目前,寡核苷酸探針已能成功的為放射性同位素、熒光素、生物素和地高辛所標(biāo)記,并成功地運(yùn)用于培養(yǎng)細(xì)胞、組織切片和染色體鋪片等的原位雜交中。雖然有些科技工作者認(rèn)為其敏感度不如來(lái)自質(zhì)粒擴(kuò)增的cRNA或DNA探針,但由于探針制備簡(jiǎn)便再加之于近年非放射性標(biāo)記的成功,寡核苷酸探針在生物基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)及臨床學(xué)科領(lǐng)域中得到較為廣泛的應(yīng)用。

  在原位雜交組織化學(xué)中應(yīng)用寡核苷酸探針,其基本操作要點(diǎn)是相同的,如雜交溫度在Tm -25℃,雜交孵育時(shí)間以過(guò)夜(16h左右)為佳。應(yīng)用寡核苷酸探針在原位雜交組織化學(xué)技術(shù)中的成功與否主要決定于探針的設(shè)計(jì),使有效配對(duì)率增加而錯(cuò)配(mismatch)減少。

 。ㄒ)地高辛標(biāo)記寡核苷酸探針的應(yīng)用

  1.組織處理

 。1)冷凍切片:厚10~20μm,貼于事先經(jīng)清潔處理及涂有粘附劑的切片上。切片保存于-80℃,在應(yīng)用于雜交實(shí)驗(yàn)前,使迅速回升到室溫,干燥,固定于3%多聚甲醛-PBS溶液中,pH7.4。PBS漂洗5min×3,孵育在2×SSc 10min。醫(yī).學(xué) 全在.線(xiàn),提供www.med126.com

  (2)石蠟包埋切片:浸入二甲苯10min移除石蠟,以100%乙醇10min ×2,空氣干燥10min,從高到低梯度乙醇(95%,80%,70%)1min/每個(gè)濃度。PBs 5min×3,孵育在2×SSc 10min。

 。3)離心細(xì)胞涂片:將細(xì)胞先以4%多聚甲醛固定,應(yīng)用離心沉淀法,將沉淀物涂于有粘附劑的載片上,應(yīng)用PBS(含5mmol/l MgCl2)5min×3漂洗。在0.1mol/L三乙醇胺含0.25%(V/V)乙酸酐10min。在0.2mol/l Tris –HCl 含(0.1mol/L甘氨酸)pH7.410min。孵育在2×SSc 10min。

  2.探針準(zhǔn)備35pmol的寡核苷酸(oligo -)探針,3’ 終末標(biāo)記以地高辛-11–dUTP。

  3.預(yù)雜交和雜交加約300μl預(yù)雜交液(配制法見(jiàn)附錄)在每張載片上,室溫孵育1h。如為鯡魚(yú)精子DNA,在應(yīng)用前須在沸水浴中加熱10min,而對(duì)酵母tRNA可不用加熱變性。

 。1)應(yīng)用預(yù)雜交液稀釋地高辛標(biāo)記的Oligo-探針,探針理想工作濃度根據(jù)于待測(cè)核苷酸含量和實(shí)踐的結(jié)果。如對(duì)于檢測(cè)大鼠垂體的前促黑激素(proopiomelanocortin,POMC)mRNA的Oligo –探針,其理想工作濃度為342ng/ml(0.342ng/μl)。

 。2)預(yù)雜交后以2×SSC漂洗,以吸水紙拭干切片周?chē),?0μl雜交液在切片上,加硅化蓋玻片,在37℃過(guò)夜。如探針大于36堿基則雜交溫度為42℃。次日室溫2×SSC液漂洗切片1h,1×SSC漂洗切片1h(室溫),0.5×SSc 37℃漂洗半小時(shí),0.5×SSC室溫漂洗半小時(shí)。

  4.地高辛顯示(同前)。

 。ǘ)同位素標(biāo)記寡核苷酸探針的應(yīng)用

  1.組織處理大鼠應(yīng)用1%戊巴比妥鈉腹腔注射麻醉,經(jīng)心臟灌注4%多聚甲醛-磷酸緩沖液中,約2h后(也可置于4℃冰箱過(guò)夜)取腦浸于同樣固定液中加10%蔗糖溶液過(guò)夜,4℃。次日恒冷箱切片(-14℃),厚14μm左右,貼于有粘附劑的載片上,37℃或室溫干燥以增加切片的粘附性。

  2.雜交前處理同本章 第二節(jié) 放射性標(biāo)記cRNA探針一節(jié) 。

  3.雜交37℃過(guò)夜,余細(xì)胞同前。

  4.雜交后漂洗2×SSc 5min×3,1×SSc 1min室溫,0.5×SSc 55℃15min×2,室溫漂洗于0.5×SSc 3min×2。梯度酒精脫水,切片室溫干燥。

  5.浸核乳膠切片浸入核乳膠,黑盒封閉,在4℃曝光2~3周(視同位素種類(lèi)),顯影,復(fù)染,觀察。

 。ǖ诙、三節(jié) 中所用試劑配制見(jiàn)附錄)。

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