不論原核或真核生物的rRNAs都是以更為復(fù)雜的初級(jí)轉(zhuǎn)錄本形式被合成的,然后再加工成為成熟的RNA分子。然而絕大多數(shù)原核生物轉(zhuǎn)錄和翻譯是同時(shí)進(jìn)行的,隨著mRNA開始的DNA上合成,核蛋白體即附著在mRNA上并以其為模板進(jìn)行蛋白質(zhì)的合成,因此原核細(xì)胞的mRNA并無特殊的轉(zhuǎn)錄后加工過程,相反,真核生物轉(zhuǎn)錄和翻譯在時(shí)間和空間上是分天的,剛轉(zhuǎn)錄出來的mRNA是分子很大的前體,即核內(nèi)不均一RNA。hnRNA分子中大約只有10%的部分轉(zhuǎn)變成成熟的mRNA,其余部分將在轉(zhuǎn)錄后的加工過程中被降解掉。
。ㄒ)mRNA的加工修飾
原核生物中轉(zhuǎn)錄生成的mRNA為多順反子,即幾個(gè)結(jié)構(gòu)基因,利用共同的啟動(dòng)子和共同終止信號(hào)經(jīng)轉(zhuǎn)錄生成一條mRNA,所以此mRNA分子編碼幾種不同的蛋白質(zhì)。例如乳糖操縱子上的Z、Y及A基因,轉(zhuǎn)錄生成的mRNA可翻譯生成三種酶,即半乳糖苷酶,透過酶和乙酰基轉(zhuǎn)移酶。原核生物中沒有核模,所以轉(zhuǎn)錄與翻譯是連續(xù)進(jìn)行的,往往轉(zhuǎn)錄還未完成,翻譯已經(jīng)開始了,因此原核生物中轉(zhuǎn)錄生成的mRNA沒有特殊的轉(zhuǎn)錄后加工修飾過程。
真核生物轉(zhuǎn)錄生成的mRNA為單順反子,即一個(gè)mRNA分子只為一種蛋白質(zhì)分子編碼。
真核生物mRNA的加工修飾,主要包括對(duì)5’端和3’端的修飾以及對(duì)中間部分進(jìn)行剪接。
1.在5’端加帽
成熟的真核生物mRNA,其結(jié)構(gòu)的5’端都有一個(gè)m7G-PPNmN結(jié)構(gòu),該結(jié)構(gòu)被稱為甲基鳥苷的帽子。如圖17-9所示。鳥苷通過5’-5’焦磷酸鍵與初級(jí)轉(zhuǎn)錄物的5’端相連。當(dāng)鳥苷上第7位碳原子被甲基化形成m7G-PPNmN時(shí),此時(shí)形成的帽子被稱為“帽0”,如果附m7G-PPNmN外,這個(gè)核糖的第“2”號(hào)碳上也甲基化,形成m7G-PPNm,稱為“帽1”,如果5’末端N1和N2中的兩個(gè)核糖均甲基化,成為m7G-PPNmPNm2,稱為“帽2”。從真核生物帽子結(jié)構(gòu)形成的復(fù)雜可以看出,生物進(jìn)化程度越高,其帽子結(jié)構(gòu)越復(fù)雜。
圖17-9 Post-transcriptional modification of mRNa showing the 7-methylguanosine cap and poly-A tail.
真核生物mRNA 5’端帽子結(jié)構(gòu)的重要性在于它是mRNa 做為翻譯起始的必要的結(jié)構(gòu),對(duì)核糖體對(duì)mRNA的識(shí)別提供了信號(hào),這種帽子結(jié)構(gòu)還可能增加mRNA的穩(wěn)定性,保護(hù)mRNa 免遭5’外切核酸酶的攻擊。
2.在3’端加尾
大多數(shù)的真核mRNA 都有3’端的多聚尾巴(A),多聚(A)尾巴大約為200bp。
多聚(A)屠巴不是由DNA編碼的,而是轉(zhuǎn)錄后在核內(nèi)加上去的。受polyA聚合酶催化,該酶能識(shí)別,mRNa 的游離3’-OH端,并加上約200個(gè)A殘基。
近年來已知,在大多數(shù)真核基因的3’一端有一個(gè)AATAA序列,這個(gè)序列是mRNa 3’-端加polyA尾的信號(hào)?亢怂崦冈诖诵盘(hào)下游10-15堿基外切斷磷酸二酯鍵,在polyA聚合酶催化下,在3’-OH上逐一引入100-200個(gè)A堿基。關(guān)于polyA尾巴的功能問題盡管經(jīng)過極其廣泛的探索,但還不完全清楚。有人推測(cè)polyA可能與mRNA從細(xì)胞核轉(zhuǎn)送到細(xì)胞質(zhì)有關(guān),但是相當(dāng)數(shù)量,的沒有polyA屠巴的mRNA如組蛋白mRNA,也照樣通過核膜進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)。還有人認(rèn)為這種結(jié)構(gòu)對(duì)真核mRNA的翻譯效率具有某種作用,并能穩(wěn)定mRNA結(jié)構(gòu),保持一定的生物半衰期。
3.mRNA前體(hnRNA)的拼接
原核生物的結(jié)構(gòu)基因是連續(xù)編碼序列,而真核生物基因往往是斷裂基因,即編碼一個(gè)蛋白質(zhì)分子的核苷酸序列被多個(gè)插入片斷所隔開,一個(gè)真核生物結(jié)構(gòu)基因中內(nèi)含子的數(shù)量,往往與這個(gè)基因的大小有關(guān),例如胰島素是一個(gè)很小的蛋白質(zhì),它結(jié)構(gòu)基因只有兩個(gè)內(nèi)含子,而有些很大的蛋白質(zhì),它的結(jié)構(gòu)基因中可以有幾十個(gè)內(nèi)含子。經(jīng)過復(fù)雜的過程后,切去內(nèi)元,將有編碼意義的核苷酸片段(Extron外元也叫外顯子)連接起來(圖17-10)。醫(yī)學(xué)全在線www.med126.com
圖17-10 Primary polymerase 11transcript of a eukaryote gene showing (a)introns after capping and addition of polyA tail.(b)Excision of introns to form the mature mRNA is called splicing.
真核生物的結(jié)構(gòu)的基因中具有可表達(dá)活性的外顯子,也含有無表達(dá)活性的內(nèi)含子,但內(nèi)含子序列下是無意義的,越來越多的實(shí)驗(yàn)證明有許多基因中的內(nèi)含子參與基因表達(dá)調(diào)控,在轉(zhuǎn)錄時(shí),外顯子及內(nèi)含子均轉(zhuǎn)錄到hnRNA中。在細(xì)胞核中hnRNA進(jìn)行剪接作用,首先在核酸內(nèi)切酶作用下剪切掉內(nèi)含子;然后在連接酶作用下,將外顯子各部分連接起來,而變?yōu)槌墒斓膍RNA,這就是剪接作用,也有少數(shù)基因的hnRNA不需進(jìn)行剪接作用,例如α-干擾素基因,圖17-11以卵清蛋白基因?yàn)槔,介紹一個(gè)典型的轉(zhuǎn)錄及加工過程。
圖17-11 卵清蛋白基因轉(zhuǎn)錄及加工過程
圖中外顯示以1、2、3、4……表示,內(nèi)含子以A、B、C、D…表示
mRNA的拼接,需要在拼接部位有供拼接識(shí)別的保守性強(qiáng)的一致順序,通過對(duì)100多種真核細(xì)胞基因的分析,發(fā)現(xiàn)外元和內(nèi)元拼接部位部分堿基順序有一定的規(guī)律(見表17-4)。
表17-4 含有內(nèi)元的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物其拼接處的堿基順序
基因區(qū)域 | Exon | Intron | Exon |
卵清蛋白內(nèi)元2 | UAAG GUGA | ~~~~~~~ | ACAGGUUG |
卵清蛋白內(nèi)元3 | UCAG GUAC | ~~~~~~~ | UCAGUCUG |
β-珠蛋白內(nèi)元1 | GCAG GUUG | ~~~~~~~ | UCAGGCUG |
β-珠蛋白內(nèi)元2 | CAGG GUGA | ~~~~~~~ | ACAGUCUC |
Igλ內(nèi)含子1 | UCAG GUCA | ~~~~~~~ | GCAGGGGC |
SV40病毒早期T抗原 | UAAG GUAA | ~~~~~~~ | UUAGAUUC |
表中劃線的堿基對(duì)拼接識(shí)別有重要作用,如將兔的β-珠蛋白的拼接部位的GT改為AT后,拼接反應(yīng)即受到影響。
mRNA前體拼機(jī)制
圖17-12 The RNA splicing mechanism.RNA splicing is catalyzed by a spliceosome formed from the assembly of U1,U2,U5,and sn RNPs(shown as green circles )plus other components (not shown).After assembly of the spliceosome ,the reaction occures in two speps:in step 1the branch-point A nucleotide in the intron sequence,which is located colse to the 3'splice site ,attacks the 5'splice site and cleaves it;the cut 5'end of the intron sequence thereby becomes covalently linked to this A nucleotide,forming the branched nucleotide shown in Figure 8-55.In step 2 the 3'-OH end of the first exon sequence,which was created in the first step,adds to the beginning of the second exon sequence,cleqving the RNA molecule at the 3'splice site;the two exon sequences are thereby joined to each other and the intron sequence is released ad a ribosone.These splicing reactions occur im the nucleus and gengerate mRNa molecules from primary RNA transcripts (mRNA precursor molecules).
mRNA拼接反應(yīng)需要有核內(nèi)小分子RNA參與它們與蛋白質(zhì)形成的復(fù)合物稱為小核糖核蛋白顆粒,SnRNA分別被命名為U1,U2,U3,U4,U5,和U6RNA。SnRNA中的U2RNA由與內(nèi)元右端拼接部位附近的UACUAA順序高度互補(bǔ),形成一個(gè)環(huán)狀結(jié)構(gòu),由特定的酶來識(shí)別切除該環(huán)狀結(jié)構(gòu),完成拼接過程,如圖17-12所示。
圖17-13 Mechanim of mRNa splicing.Note that,for clarity,the process is shown in two stages;energy is not required for the process since transesterification reactions are involved.
真核生物 mRNA前體在剪接過程中,還可以形成套索樣的結(jié)構(gòu),在內(nèi)含子序列中常有一個(gè)分支部位的腺苷酸殘基,它的2’-OH可以自動(dòng)攻擊內(nèi)含子5’端與外顯子1連接的磷酸二酯鍵,切開了外噗子1,而腺苷酸原來已有3’,5’--磷酸二酯鍵相連的兩個(gè)相鄰的核苷酸殘基,加上此3’,5’-磷酸二酯鍵連接后,在腺苷酸處出現(xiàn)了一個(gè)套索,已被切下的外顯子1的3’-OH攻擊內(nèi)含子3’末端與外顯子2之間的3’,5’-磷酸二酯鍵,鍵斷裂后,內(nèi)含子以套索的形式被節(jié)下來,此時(shí)外顯子1和外顯子2可以連接起來(圖17-13)。
不論拼接過程如何,拼接必須極為精確,否則會(huì)導(dǎo)致遺傳信息傳遞障礙,合成的蛋白質(zhì)可能喪失其正常的功能。我國(guó)南方廣大地區(qū)是β-地中海貧血的高發(fā)區(qū),這是由于β-珠蛋白鏈的合成受到部分或完全抑制所引起的一種血紅蛋白病。實(shí)驗(yàn)表明β-珠蛋白基因元1中核苷酸的點(diǎn)突變改變了正常拼接部位的堿基順序,結(jié)果造成錯(cuò)誤部位的拼接。加工成熟的mRNA雖能翻譯,但產(chǎn)物不是正常的β-珠蛋白,結(jié)果引起血紅蛋白級(jí)結(jié)構(gòu)和功能的改變。