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實用免疫細(xì)胞與核酸:第一節(jié) 原位雜交技術(shù)在染色體鋪片的應(yīng)用

近年,不少科技工作者將原位雜交組織細(xì)胞化學(xué)技術(shù)(ISHH)應(yīng)用于細(xì)胞分裂中期(Metaphase)和分裂間期(Interphase)的染色體鋪片上,利用標(biāo)記的核苷酸探針與之進(jìn)行雜交,可在光鏡或電鏡水平檢測到不同的特異性的標(biāo)記物。目前,原位雜交組織化學(xué)在染色體鋪片的應(yīng)用主要在…

近年,不少科技工作者將原位雜交組織細(xì)胞化學(xué)技術(shù)(ISHH)應(yīng)用于細(xì)胞分裂中期(Metaphase)和分裂間期(Interphase)的染色體鋪片上,利用標(biāo)記的核苷酸探針與之進(jìn)行雜交,可在光鏡或電鏡水平檢測到不同的特異性的標(biāo)記物。目前,原位雜交組織化學(xué)在染色體鋪片的應(yīng)用主要在三個方面:染色體的基因分配或基因圖(Gene assignment)的研究、癌細(xì)胞或癌前組織的染色體異常的間期細(xì)胞遺傳學(xué)分析研究和性染色體對胚胎的生前診斷。在依次介紹這些方法的應(yīng)用以前,我們先簡要介紹一個有關(guān)染色體的基本的知識和染色體鋪片的制作方法。

一、有關(guān)染色體的基本知識及制片

(一)染色體的形態(tài)結(jié)構(gòu)

體細(xì)胞的染色體是46個,23個,其中22對是常染色體,一對是性染色體。男性一對XY,女性為XX。染色體的形態(tài)隨著細(xì)胞周期的不同而有所改變,在光學(xué)顯微鏡下所看到的染色體是細(xì)胞分裂中期染色體(metaphase chromsome)。

每個染色體含有兩條染色單體,呈赤道狀彼此分離,只有著絲粒處相連。根據(jù)著絲粒的位置分為三種類型,中部著絲粒型,亞中部著絲粒和端著絲粒型(圖21-1)。

圖21-1 正常人體細(xì)胞的三種染色體

1.中部著絲點染色體;2.近中部著絲點染色體;3.www.med126.com近端部著絲點染色體

1.非顯帶染色體特征分為七組

A組(1~3):為最大的具中部著絲粒染色體,這組染色體相互間很易區(qū)別。第1號和第2號染色體大小相似,唯第2號染色體為近中部著絲粒染色法。第3號染色體較1、2號染色體小,為中部著絲粒染色體。

B組(4~5):為大的具中部著絲粒染色體。2對染色體之間在形態(tài)和長度上較難區(qū)別。

C組(6~12號和X):為中等大小的具中部或近中部著絲粒染色體。這組染色體較難區(qū)分,其中第6、7、11號和X染色體為中部著絲粒染色體,第8、9、10和12號染色體為近中部著絲粒染色體。女性為2個X染色體。男性只有1個X染色體。

D組(13~15號):為zxtf.net.cn/Article/中等大小的具近端著絲粒染色體。在其短臂上有隨體。與他組染色體有明顯區(qū)別。但3對染色體之間較難區(qū)別。

E組(16~18號):為小的具中部或近中部著絲粒染色體。第16號染色體為中部著絲粒染色體,第17號和18號染色體為近中部著絲粒染色體。不過,著絲粒位置第18號較第17號染色體更近端部。

F組(19~20號):為更小的中部著絲粒染色體。2對染色體之間,形態(tài)上很難區(qū)別。

G組(21~22號和Y):為最小的近端著絲粒染色體。第21號和22號染色體大小相似,且短臂上常連有隨體。Y染色體常比第21和22號染色體大、染色深。且無隨體。Y染色體長臂2個染色單體比較靠攏,長臂末端也較模糊。

2.G帶染色體的特征

第1號染色體:識別并不困難,但初學(xué)者易把長短臂顛倒。短臂的近側(cè)1/2處有2個深帶。遠(yuǎn)側(cè)有一半幾乎為淺染區(qū);短臂共分3區(qū)。界標(biāo)為近側(cè)的深帶(2區(qū)1帶)和中段的深帶(3區(qū)1帶)。長臂近側(cè)為一窄的淺帶。中段和遠(yuǎn)側(cè)段各有2條深帶;長臂共分4區(qū),界標(biāo)為次縊痕遠(yuǎn)側(cè)的淺帶(2區(qū)1帶)、中段的深帶(3區(qū)1帶)和遠(yuǎn)側(cè)的深帶(4區(qū)1帶)。

第2號染色體:短臂可見4條深帶。中段的2條深帶常互相靠近,表現(xiàn)為1條深帶;短臂共分2區(qū),界標(biāo)為1淺帶(2區(qū)1帶)。長臂可見4~7帶,近側(cè)著色甚淺,中段及遠(yuǎn)側(cè)著色較深;長臂共分3區(qū),界標(biāo)為2個淺帶(2區(qū)1帶和3區(qū)1帶)。

第3號染色體:短臂近側(cè)可見2條深帶;遠(yuǎn)側(cè)可見3條深帶,其中遠(yuǎn)端的1條帶較窄,染色淺;短臂分為2區(qū),界標(biāo)為1淺帶(2區(qū)1帶),長臂近側(cè)和遠(yuǎn)側(cè)各有1條較寬的深帶:好的標(biāo)本近側(cè)深帶可分為2條深帶,遠(yuǎn)側(cè)深帶可分為3~4條深帶;長臂分為2區(qū),界標(biāo)為1淺帶(2區(qū)1帶)。長臂深帶寬度略大于短臂深帶。

第4號染色體:短臂有1~2條深帶,只1區(qū)。長臂有均勻分布的4條深帶;長臂分3區(qū);界標(biāo)為2淺帶(2區(qū)1帶和3區(qū)1帶)。

第5號染色體:短臂有1條深帶,只1區(qū)。長臂有5條深帶,中段的3條深帶?拷;長臂分3區(qū),界標(biāo)有1深帶(2區(qū)1帶)和1淺帶(3區(qū)1帶)。

第6號染色體:短臂近側(cè)有1寬的淺帶,遠(yuǎn)側(cè)為1深帶;短臂分2區(qū),界標(biāo)為1淺帶(2區(qū)1帶)。

第7號染色體:短臂有2~3條深帶,近末端帶著色很深;短臂分2區(qū),界標(biāo)為1深帶(2區(qū)1帶)長臂有3條深帶,近側(cè)和中部的2條帶較深;長臂分3區(qū),界標(biāo)為2深帶(2區(qū)1帶和3區(qū)1帶)。

第8號染色體:短臂有2條深帶,遠(yuǎn)側(cè)深帶較近側(cè)深帶著色深;短臂分2區(qū),界標(biāo)為1淺帶(2區(qū)1帶)。長臂有3~4條深帶,遠(yuǎn)中的深帶著色較深;長臂分2區(qū),界標(biāo)為1深帶(2區(qū)1帶)。

第9號染色體:短臂有1~2條深帶;短臂分2區(qū),界標(biāo)為1深帶(2區(qū)1帶)。長臂2條深帶。長臂分3區(qū),界標(biāo)為2深帶(2區(qū)1帶和3區(qū)1帶)。

第10號染色體:短臂有2條深帶,近側(cè)較近側(cè)深帶著色淺;短臂只1區(qū)。長臂有3條深帶,近側(cè)深帶著色更深;長臂分2區(qū),界標(biāo)為1深帶(2區(qū)1帶)。

第11號染色體:短臂有1~2條深帶;短臂只1區(qū)。長臂有2條深帶,在近側(cè)深帶與著絲粒之間有1寬的淺帶;長臂為2區(qū),界標(biāo)為1淺帶(2區(qū)1帶)。

第12號染色體:短臂有1條深帶;短臂只1區(qū)。長臂有3條深帶,中間的1條深帶寬,近側(cè)深帶與著絲粒的距離較第11號染色體近;長臂分2區(qū),界標(biāo)為1深帶(2區(qū)1帶)。

第13號染色體:長臂有4條深帶,中間2條深帶寬;長臂分3區(qū),界標(biāo)為中間的2條深帶(2區(qū)1帶及3區(qū)1帶)。

第14號染色體:長臂有45條深帶,近側(cè)的第2條帶和遠(yuǎn)側(cè)的帶著色更深;長臂分3區(qū),界標(biāo)為2條深帶(2區(qū)1帶和3區(qū)1帶)。

第15號染色體:長臂有4條深帶,近側(cè)的第2條帶較寬;長臂分2區(qū),界標(biāo)為1深帶(2區(qū)1帶)。

第16號染色體:短臂有1~2條深帶,短臂只1區(qū)。長臂有2條深帶,近中部深帶明顯;長臂分2區(qū),界標(biāo)為1深帶(2區(qū)1帶)。

第17號染色體:短臂有1深帶;只1區(qū)。長臂1~2深帶,遠(yuǎn)側(cè)深帶較寬,在深帶與著絲粒之間有1寬的淺帶;分2區(qū),界標(biāo)為淺帶(2區(qū)1帶)。

第18號染色體:短臂為1淺帶區(qū)。長臂有2條深帶;為2區(qū),界標(biāo)是1淺帶(2區(qū)1帶)。

第19號染色體:著色最淺。著絲粒周圍為深帶。短臂和長臂均為1區(qū)。

第20號染色體:短臂有1深帶,較寬;短臂和長臂均為1區(qū)。長臂有1深帶,較寬。

第21號染色體:最小的1個染色體。長臂緊按著絲粒處有1深帶,較寬;長臂為2區(qū),界標(biāo)為1深帶(2區(qū)1帶)。

第22號染色體:較21號色體長,長臂緊接著絲粒處有1深帶,較窄。短臂和長臂均為1區(qū)。

X染色體:短臂中部有1條深帶;分2區(qū),界標(biāo)是深帶(2區(qū)1帶)。長臂有4條深帶,其中近槽深帶最寬;分2區(qū),界標(biāo)是近側(cè)深帶(2區(qū)1帶)。

Y染色體:長臂遠(yuǎn)側(cè)半色著深,為1深帶;短臂和長臂均為1區(qū)。

現(xiàn)在國內(nèi)流行一種辨認(rèn)G帶每個染色體的口訣,稍加修改如下:

一禿二蛇三蝶飄,四象鞭炮五黑腰;

六號短空小白臉,七上八下九苗條;

十號長臂近帶好,十一低來十二高;

十三十四十五號,三個長臂一二一;

十六長臂縊痕大,十七長臂帶腳鐐;

十八人小肚皮大,十九中間一黑腰;

二十頭重腳腳底輕,二十一帶寬身體。

二十二帶小身體大,Y長一寬近末端;

X短臂一、長臂三,中間象個工字般。

(二)染色體G顯帶技術(shù)

1.原理染色體的化學(xué)成份是核酸和蛋白質(zhì)兩部分。核酸以DNA為主,蛋白質(zhì)有組蛋白和非組蛋白兩種。因此染色體經(jīng)蛋白水解酶類物質(zhì)處理后,蛋白質(zhì)已被水解而使DNA分子中堿基暴露,由于堿基中G/C和A/T組合的比例不同,對染料結(jié)合的程度不一,如這一段A/T堿基的成份多,則Giemsa染料易與它結(jié)合成深染;另一段G/C堿基的成份多,則Giemsa染料不易與其結(jié)合,結(jié)果成淡染,由于整條染色體上A/T和G/C的分布不勻,這樣在染色體上呈現(xiàn)出深淺不一的條紋或者稱帶紋,該技術(shù)用Giemsa染色,故其帶型稱為G帶。

2.操作過程

(1)按常規(guī)染色體技術(shù)制片。

(2)制好的染色體玻片,在80℃烘箱中,烘烤2h,置于室溫。

(3)4℃冰箱PBS液5min。

(4)4℃冰箱PBS緩沖液含胰蛋白酶終濃度0.025%,消化10min。

(5)蒸餾水洗凈胰酶

(6)Giemsa染色20min。

(7)蒸餾水洗凈染色液,晾干鏡檢。

4℃低溫胰酶處理片子,其優(yōu)點是:時間較長,易掌握。配制1次試劑可用1~2個月。

(三)高分辨染色體G帶技術(shù)

1.原理常規(guī)的G帶顯帶技術(shù),在人類染色體中僅觀察到320~450條帶紋,對于一些染色體細(xì)微結(jié)構(gòu)異常的識別是不夠的。

氨甲碟呤抑制二氫葉酸還原酶,阻止葉酸轉(zhuǎn)變?yōu)樗臍淙~酸,從而干擾了脫氧胸腺嘧啶核苷酸的合成,阻止了DNA的復(fù)制,使細(xì)胞被阻止在S期內(nèi)。胸腺嘧啶核苷解除氨甲喋呤的作用,讓被阻滯的細(xì)胞同時開始進(jìn)行DNA復(fù)制,進(jìn)而同步分裂;放線菌素D可增加染色體的長度,能顯示更多的亞帶。放線菌素D與核酸相互作用:①插入脫氧鳥嘌呤核苷酸和脫氧胞啶核苷酸之間,使DNA變長;②能與染色體縮短有關(guān)的特殊蛋白和DNA結(jié)合,因此,抑制了染色體正常的收縮過程。秋水仙胺抑制紡垂絲的形成,可以得到較多的晚前期、前中期、早中期的分裂相。這樣染色體帶紋可增加到500和850條,甚至可達(dá)1200~2000條之多。這一步對于研究較細(xì)小的染色體缺陷的基因定位,具有很大的意義。

2.材料和方法

(1)4ml培養(yǎng)液(為從日本進(jìn)口的RPMi 1640或從美國進(jìn)口的F10液)雖自制的小牛血清1ml。每ml加青、鏈霉素各100單位,pH=7.2。

(2)每瓶培養(yǎng)液內(nèi),另加自制的PHA或重慶產(chǎn)的PHA2.5mg。

(3)取外周血2ml,分別裝入含培養(yǎng)液的4個培養(yǎng)瓶內(nèi)。

(4)37℃孵育箱內(nèi)培養(yǎng)72h。

(5)加入氨甲喋呤,最終濃度10-7mol/L,繼續(xù)培養(yǎng)17h。

(6)用不含血清的培養(yǎng)液沖洗兩次后,將上清液吸出,再加入含胸腺嘧啶核苷(最終濃度為10-5mol/L)的培養(yǎng)液,繼續(xù)培養(yǎng)3h。

(7)再加入放線菌素D,最終濃度為3μg/ml,培養(yǎng)2h。

(8)加秋水仙胺,最終濃度為0.03μg/ml,培養(yǎng)2h。

(9)按常規(guī)染色體技術(shù)制片。

(10)按一般常用的G帶顯帶技術(shù),顯示帶紋。

3.注意事項

(1)高分辨染色體,重疊多,應(yīng)增加固定次數(shù)和固定時間,可置于4℃冰箱存放24h后制片,用高距離滴片,以使染色體分散開。

(2)細(xì)胞培養(yǎng)液同步化后,如果用5-溴-2脫氧尿核苷(5-bromodeoxyuridine,BrdU),則需加黑物包裝進(jìn)行暗培養(yǎng)。

(四)外周血培養(yǎng)及染色體制片技術(shù)

1.國內(nèi)應(yīng)用的外周血培養(yǎng)染色體技術(shù)

(1)原理:外周血染色體制備是目前應(yīng)用最廣泛的細(xì)胞遺傳學(xué)診斷技術(shù),亦是基本的實驗技術(shù),由于取材容易,培養(yǎng)過程比較簡單,短期內(nèi)可以得到結(jié)果,所以其實用價值很高。

血液中含有紅、白兩類細(xì)胞,它們均是處于未分裂的間期細(xì)胞。紅細(xì)胞沒有核,無分裂能力;白細(xì)胞類雖有細(xì)胞核存在,但是外周血中處于休止期。植物血球凝集素(簡稱PHA)能促使淋巴細(xì)胞和單核細(xì)胞轉(zhuǎn)化為具有分裂作用的母細(xì)胞。染色體只有在細(xì)胞分裂中期時最典型。秋水仙素類藥的藥物能抑制紡錘絲的形成,使細(xì)胞分裂停止于中期,低滲處理使細(xì)胞膨脹,細(xì)胞膜破裂,染色體分散,這樣就可便于分析。

簡意流程圖:

(2)操作過程

①采血:無菌干針筒從靜脈取血1~2ml,用肝素抗凝(約每毫升全血內(nèi)含肝素100單位)。

②培養(yǎng)液配制:RPMI 1640 4ml

小牛血清 1ml

1%PHA(自制)0.2ml

調(diào)節(jié) pH為7.4后置于-20℃冰箱

③標(biāo)本接種:每5ml培養(yǎng)液加入抗凝全血0.5ml。

④培養(yǎng)細(xì)胞:將接種好的培養(yǎng)瓶置于37℃恒溫箱中培養(yǎng)72h。

⑤阻止分裂:培養(yǎng)至68h,加秋水仙素,最終濃度0.02μl/ml,搖勻后置于37℃恒溫箱中繼續(xù)培養(yǎng)4h。

⑥收獲:培養(yǎng)物混合后,置于10ml離心管內(nèi),離心10min(1000轉(zhuǎn)/min),去上清液。留下培養(yǎng)物。

⑦低滲處理:低滲液可用0.56%的KCl(或0.075mol/l KCl)5~7ml,用吸管打散沉淀物,置于37℃水浴箱中保溫20min,然后加入固定液(3份甲醇:1份冰乙酸)1ml用吸管打勻,預(yù)固定1~2min。

⑧離心:1000轉(zhuǎn)/min離心10min。

⑨固定:吸去上清液,留下沉淀加上述固定液6~8ml,用吸管將沉淀物打散,固定30min后離心,1000轉(zhuǎn)/min離心10min,取出吸去上清液留下沉淀。

⑩重復(fù)上述固定離心1次。

⑾標(biāo)本制作:最后1次固定、離心后吸去上清液,留下沉淀再加少量新鮮固定液約0.3ml打散細(xì)胞懸浮液即可進(jìn)行制片。制片之前先將載玻片經(jīng)清潔液洗凈處理后,置于冰箱內(nèi)制成冰片。取冰片1張滴上2~3滴細(xì)胞懸液。利用冰片的表面張力關(guān)系使液體迅速向玻片四周散開,與此同時用嘴輕輕吹向滴片處,以助其更快散開,然后在酒精燈火上通過7~8次后,自然干燥或烤干均可。

⑿染色:Giemsa染液1份和pH7.4磷酸緩沖液9份,混合后,染色20min,蒸餾水洗去余下染液,晾干,鏡檢觀察。

(3)注意事項

①無菌操作是關(guān)鍵。培養(yǎng)液不得污染。

②所用藥品不得失效,特別是PHA,既要使淋巴細(xì)胞轉(zhuǎn)化,又不能過量。

③小牛血清優(yōu)質(zhì)、無菌。

④秋水仙清素低濃度4~6h效果最佳,過量則染色體易收縮。

⑤固定液和Giemsa染液要求新鮮配用。

⑥培養(yǎng)時間72h較好。

(4)各種物品清洗與消毒

①玻璃器皿用后,立即用自來水沖洗,再用洗衣粉刷洗,然后用自來水沖洗。待干,泡入清潔液24~48h,取出,自來水沖洗,再用雙蒸水沖洗,干后備用。

②接觸洗液時,帶上橡皮手套,圍裙等防護(hù)品。

常用清潔液配制:

重鉻酸鉀25g

水200ml

濃硫酸1000ml

③先將重鉻酸鉀在水中溶解,然后慢慢加入濃硫酸,邊加邊攪拌,防止過度發(fā)熱。使用3~6月后檢查,若變綠表示失效。

④G5、G6漏斗的處理:水洗凈、晾干,于濃硫酸泡(或洗液中泡)24h,再用蒸餾水沖洗至加入1%BaCl2滴無白色沉淀為止。包裝消毒,15磅20min。

(5)橡皮塞的處理

新的橡皮塞洗后,先用0.5N NaOH煮沸15min,再用0.5n HCl煮沸15min,流水沖洗10min,用雙蒸水泡24h,雙蒸水沖洗,晾干,15磅20min高壓滅菌。

(6)金屬器械清洗

先用紗布或紙擦去防銹油,然后用洗滌液清洗,再用清水或蒸餾水洗凈,擦干或烘干備用。

2.外周血細(xì)胞培養(yǎng)法(Bhatt B and McGee JOD,1990)

(1)收集靜脈血(無菌),加肝素抗凝(20單位/ml);

(2)加0.8ml全血入每個培養(yǎng)瓶(含10ml培養(yǎng)液),37℃培養(yǎng)72h;

培養(yǎng)液配制:RPMI 76ml(Gibco,Cat.No.041-1875M)

小牛血清 20ml

PHA  2.0ml

(3)加100μl Brdu于培養(yǎng)瓶中,37℃再孵育16~17h;

(4)離心(1200rpm)8min,棄去上清液,沉淀中加入10ml RPMI 1640培養(yǎng)液,混勻;

(5)重復(fù)步驟(4);

(6)沉淀中加入10ml新配制的完全培養(yǎng)液(含2.5μg/ml胸腺嘧啶),重新置于37℃孵育6~7h;

(7)在收獲培養(yǎng)細(xì)胞前15~30min,可加Colcemid,但當(dāng)同時應(yīng)用BrdU時這就并非十分必要。因為BrdU是胸腺嘧啶核苷的類似物,能使染色體在富含異染色質(zhì)處斷裂分解,從而使顯帶明顯;

(8)1200rpm離心培養(yǎng)細(xì)胞,棄去上清液,加入1ml 0.56% KCl(事先預(yù)熱至37℃),繼續(xù)加入0.56%KCl使總?cè)萘窟_(dá)到10ml,在37℃孵育10min;

(9)如上述離心,棄去上清液,在沉淀的細(xì)胞內(nèi)加入新鮮的冷固定劑,(甲醇:冰醋酸=3:1,新鮮配制,保存在冰上),置冰上至少20min;

(10)重復(fù)步驟(9)3~4次,直至細(xì)胞懸液清潔無色;

(11)可較長期保存在冰的固定劑內(nèi)(-20℃)或再離心后加入0.5~1.0ml新鮮固定劑,置于冰上;

(12)玻璃載片放在Decon(清潔液)或其它的清潔液內(nèi)過夜,次日用自來水沖洗,繼之蒸餾水漂洗,在60~75℃干燥,然后把載片孵育在2%丙酮液內(nèi),室溫,60min。自來水沖洗,再在60~75℃干燥;

(13)每張載片上加10μl的細(xì)胞混懸液,空氣干燥,在24h后可應(yīng)用于雜交實驗,也可保存在-4℃達(dá)8周之久(試劑配制法見附錄四)。

二、應(yīng)用ISHH技術(shù)對染色體制片、基因分配(Chromosomalassignment of genes)的研究

(一)基本原理

染色體上基因位置分配的研究,又叫染色體圖的研究,包括基因名稱、基因在染色體的位置及與相鄰基因的距離及其核酸序列的研究。研究基因圖的方法包括家系的連鎖分析法、體細(xì)胞雜交法、重組DNA技術(shù)和原位雜交法。果蠅的線形基因圖和大腸桿菌、T4噬菌體兩者的環(huán)狀基因圖都已繪成,目前正致力于人類基因圖的繪制。人類基因約有5萬~10萬個,根據(jù)第八次國際人類基因定位工作會議,已定位的人類基因總數(shù)達(dá)1479個。

ISHH技術(shù)對染色體基因圖的研究,是用同位素或生物素、地高辛標(biāo)記的核酸探針,直接同中期的染色體鋪片行雜交。早期的研究是用于重復(fù)序列DNA的定位,如編碼核糖體的基因18S和28S核糖體RNA定位于第13~15號染色體和第21~22號染色體短臂次縊痕區(qū)。5S核糖體RNA定位于第1號染色體上長臂的遠(yuǎn)側(cè)Iq42~I(xiàn)q43。近年已能進(jìn)行單拷貝基因的定位,如胰島素基因定位于IIp 15上、C-mos原癌基因定位于Sq22上、N-ras原癌基因定位于IPI34。在染色體11的短臂上,利用ISHH技術(shù)證明4個基因依次排列,從短臂的遠(yuǎn)端依次為胰島素、β-球蛋白、HRASI和PTH。

(二)操作步驟(Bhatt and MCGee, 1990)

在前面已介紹了制備血培養(yǎng)染色體鋪片的方法。下面介紹的是在染色體制片上用免疫金銀染色法進(jìn)行原位雜交的基因定位顯示、結(jié)合Giemsa染色顯帶技術(shù)的操作步驟。

1.移除內(nèi)源性RNA

(1)加100μl RNA酶溶液,覆以蓋玻片,放在有少許2×SSC溶液的濕盒內(nèi)孵育,37℃,60min。

(2)在2×SSC溶液內(nèi)移除蓋玻片,以2×SSC洗2×3min。

(3)等級酒精系列脫水,10%,50%,70%,90%和100%,各1min,各1min?諝飧稍。

2.探針標(biāo)記和純化用缺口平移法將生物素11-dUTP標(biāo)記在DNA核酸探針上。

3.變性與雜交

加20~100ng生物素標(biāo)記探針到雜交液中,加入5μl 20mg/ml人或鯡魚精子DNA,總?cè)萘繛?0~40μl,離心5s,混勻后,滴于染色體鋪片,覆以蓋玻片,蓋片四周以橡皮泥封固。放入盛2×SSC溶液溫盒內(nèi)75℃7~8min,使之變性,繼之于37℃孵育16h。

4.雜交后漂洗2×SSC溶液內(nèi)移除蓋玻片,將載片浸入含50%甲酰胺的2×SSC溶液內(nèi),pH7.2,20min,42℃。然后作下列程序漂洗

溶液 漂洗時間溫度

2×SSc 20min42℃

1×SSC20min 室溫

0.1×SSc  20min 室溫

5.免疫細(xì)胞化學(xué)顯示

(1)孵育載片于PBt 15min,將片緣及背面擦干,加100μl一抗于載片(抗生物素抗血清1:100,以PBT稀釋),孵育于37℃40~60min。

(2)快速用PBT沖洗,擦干片緣及背面,加100μl二抗抗血清(羊抗兔IgG結(jié)合10~20nm金粒,以PBT1:50稀釋)于載片染色體鋪片部位,37℃孵育45~60min。

(3)PBS洗3×5min。

(4)蒸餾水洗3×5min。

(5)加數(shù)滴銀溶液于載片上,在光鏡下監(jiān)測,大約需5~18min可見在染色體上出現(xiàn)銀斑點。

(6)蒸餾水洗。PBT配制見附錄3。

6.顯帶復(fù)制(Replication banding)

(1)應(yīng)用5μg/ml Hoechst 33258在2×SSC溶液內(nèi),暗室中染載片20min。

(2)蒸餾水洗,以2×SSC封固,覆以蓋玻片,蓋片四周封以橡皮泥。

(3)紫外光照射1~16h。

(4)蒸餾水洗和以10%Giemsa(磷酸緩沖液稀釋,pH6.8~7.2)染色10min。

(5)蒸餾水沖洗,空氣干燥,以DPX封固。

(6)光鏡下觀察,可見棕色的銀斑點在染色體上的定位,并顯示其與染色體分帶的關(guān)系。

三、利用ISHH技術(shù)對腫瘤或癌前組織的細(xì)胞間期染色體鋪片進(jìn)行研究

(一)基本原理

在惡性的或癌前病變的組織,染色體組含量與結(jié)構(gòu)的畸變在部分病例中與疾病的預(yù)后相一致。由于染色體基因的變化可能導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生與進(jìn)展,利用一些技術(shù)預(yù)測這些遺傳物質(zhì)的變化可為惡性腫瘤的檢測及了解其進(jìn)展和預(yù)后提供資料。流式細(xì)胞計(FCM)和染色體組型,即核型分析(karyothping analyses)等技術(shù)曾被用于這個領(lǐng)域的研究。FCM可測定腫瘤細(xì)胞DNA的含量,但它不能顯示特異性染色體的結(jié)構(gòu)異常,而且對微量的DNA含量改變難以檢測。核型分析可以顯示染色體結(jié)構(gòu)和含量的變化,但要分析腫瘤細(xì)胞的核型只有在細(xì)胞培養(yǎng)以后。細(xì)胞培養(yǎng)時細(xì)胞的高度分裂指數(shù)和細(xì)胞的生長會導(dǎo)致染色體物質(zhì)的丟失,而且核型分析不能顯示特異性DNA探針的原位雜交技術(shù),能夠檢測在細(xì)胞分裂間期細(xì)胞核內(nèi)染色體數(shù)量和結(jié)構(gòu)的異常變化。因此,這項技術(shù)又被稱為“間期細(xì)胞遺傳學(xué)分析法(Interphase Cytogenetics Analysis, ICA)。間期細(xì)胞遺傳學(xué)的基本原理是利用合成的特異性DNA探針,標(biāo)記以同位素、生物素、地高辛或熒光素,對外周血、腫瘤細(xì)胞或癌前組織的離散培養(yǎng)細(xì)胞的染色體鋪片或切片進(jìn)行DNA-DNA原位雜交,其雜交定位以熒光法、放射自顯影或免疫組化法顯示。目前ICA已廣泛應(yīng)用于生前診斷、腫瘤組織活檢材料的診斷和基因異常的診斷。在腫瘤細(xì)胞方面,在乳腺癌,神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤、睪丸腫瘤,婦科腫瘤和膀胱腫瘤等均有實驗報告。現(xiàn)已能提供的DNA探針有染色體1,7,8,9,10,15,16,17,18和性染色體X、Y,以及識別一些染色體特征性部位如著絲點(centromeric region)、染色體端極區(qū)(telomere region)的特異性重復(fù)靶核苷序列和隨體的DNA探針,多數(shù)為合成的寡核苷酸探針,在應(yīng)用上采取ISHH和FCM以及免疫組化相結(jié)合(有時還結(jié)合核型分析)的綜合研究法(圖21-2),也可用多種標(biāo)記物顯示不同顏色或不同標(biāo)記在一張切片上同時顯示多個染色體的結(jié)構(gòu)或DNA含量異常,如異硫氰酸熒光素(FITC)和羅丹明200結(jié)合,前者顯示黃綠色,后者顯示紅色,ABC-DAB顯示法與地高辛-堿性磷酸酶系統(tǒng)相結(jié)合,前者反應(yīng)物為棕色,后者為紫藍(lán)色。這種聯(lián)合應(yīng)用法又叫多靶點原位雜交法(multiple-target ISH)。

圖21-2 腫瘤組織處理流程圖

(二)基本操作方法

1.玻片與組織前處理

(1)腫瘤細(xì)胞混懸液的制備:新鮮的從活檢或外科手術(shù)或尸檢獲得的材料建議按圖21-2的流程處理進(jìn)行綜合研究。用以制作細(xì)胞混懸液的組織在處理前可保存于液氮內(nèi)。組織塊在玻皿中切碎或用細(xì)胞打碎機打碎,用100μm孔直徑的尼龍網(wǎng)過濾器濾過,固定在70%乙醇,-20℃,如保存于-39℃可保存數(shù)月至數(shù)年。

(2)分離的細(xì)胞由于表面有細(xì)胞質(zhì)的覆蓋,在熒光顯微鏡下會顯示強烈的自動熒光,從而掩蓋了ISHH的信號?刹扇∠铝袃煞N方法移除覆蓋的細(xì)胞質(zhì);

①乙醇固定后的細(xì)胞,應(yīng)用以前在新鮮制備的甲醇/醋酸(3:1)固定液內(nèi)0℃,5min。滴2~3滴固定后的細(xì)胞混懸液于涂有粘附劑的載片上,空氣干燥,然后快速浸入70%醋酸內(nèi)10~60s。應(yīng)用蒸餾水洗,在100%乙醇內(nèi)脫水,空氣干燥。

②應(yīng)用胃蛋白酶蛋白水解作用。加5μl細(xì)胞混懸液于載片上,空氣干燥30min或在80℃烤箱中干燥。胃蛋白酶(2500~3500單位/mg蛋白質(zhì),Sigma,USA)應(yīng)用0.01mol/L HCl稀釋至50~400μg/ml,10min 37℃;再用0.03% H2O2和PBS漂洗,以4%多聚甲醛固定,0℃,5min;載片脫水,空氣干燥,在80℃加熱變性30min。這個方法較①更好,能移除蛋白質(zhì)、暴露核DNA和有助于探針的穿透,最重要的能較好的保持形態(tài)學(xué)的結(jié)構(gòu),以利于ISHH的熒光信號的顯示。應(yīng)用①法,細(xì)胞經(jīng)常呈扁盤狀,而且細(xì)胞質(zhì)的自動熒光未完全消失,影響ISHH熒光信號的顯示,但實驗表明,必須嚴(yán)格掌握胃蛋白酶的濃度,過低,由于細(xì)胞質(zhì)的覆蓋,基因拷貝數(shù)會減低,而過高濃度的胃蛋白酶會導(dǎo)致過度消化影響細(xì)胞的形態(tài)結(jié)構(gòu)。

(3)組織切片處理

①冷凍切片:切片厚5μm,放置有粘附劑的載片上,空氣干燥,固定在4%多聚甲醛-PBS溶液,0℃,15min。固定后以PBS和0.01n HCl漂洗,以胃蛋白酶(20~100μg/ml,用0.01N HCl配制),37℃,30min,PBS漂洗2×5min,在4%多聚甲醛內(nèi)固定15min(0℃),PBS洗2×5min,系列等級乙醇脫水,空氣干燥。雜交前,在80℃加熱30min使之變性。

②石蠟切片:切片厚5μm,漂洗在40℃溫水中,撈片于有粘附劑的載片上,空氣干燥,56℃加熱1~16h,二甲苯脫蠟2×3min甲醇沖洗2×5min。應(yīng)用1%H2O2(用甲醇配)溶液封閉內(nèi)源性過氧化物酶活性。以甲醇沖洗,空氣干燥,以胃蛋白酶(4mg/ml,用0.2n HCl配)37℃ 30min。消化后,載片以PBS沖洗。在雜交前,載片孵育于1%甘氨酸溶液-PBS中15min,以PBS沖洗和系列酒精脫水,空氣干燥。載片在80℃孵育30min使之變性。

2.雜交本實驗的雜交液略區(qū)別于其它實驗,否則染色體1號和18號的DNA探針不僅結(jié)合1號和18號染色體,還會同時結(jié)合染色體9,6,13,21。雜交液配方:

甲酰胺 60%(V/V,2×SSC配,pH5.0)

鯡魚精子DNA 1μg/μl

余與一般雜交液配制相同

對多靶點ISHH,須另加入1mmol/L KCN入雜交液,每張載片加5μl的含特異性DNA探針(2.5ng/μl)的雜交液,以蓋片覆蓋,四周用橡皮泥封固,先在80℃熱板上5~10min使DNA變性,細(xì)胞混懸液制片變性時間只需2.5min,然后在37℃雜交,孵育過夜。

3.雜交后漂洗同本節(jié)。ǘ)雜交后漂洗步驟。

4.顯示步驟根據(jù)標(biāo)記物的種類(同位素、熒光素、生物素或地高辛)分別進(jìn)行顯示(與第二十章 中敘述相同)。

5.結(jié)果在光鏡下可見染色體結(jié)構(gòu)的改變,如在膀胱腫瘤細(xì)胞,其DNA含量經(jīng)FCM顯示高于正常組織1倍,在雙靶ISHH顯示載片上,可見腫瘤細(xì)胞間期核內(nèi),1號染色體為3倍體,而18號染色體為2倍體。在腫瘤細(xì)胞內(nèi)應(yīng)用雙重靶點或多重靶點ISHH技術(shù)可見細(xì)胞間期核內(nèi)多個染色體的眾多畸變相。

ISHH技術(shù)作為一項快速與敏感的偵檢細(xì)胞間期細(xì)胞核內(nèi)染色體畸變的新技術(shù),可結(jié)合病理材料的常規(guī)組織切片、免疫組化染色和FCM等對病檢材料做出早期的、準(zhǔn)確的診斷,并對腫瘤的預(yù)后與進(jìn)展等有所了解。本技術(shù)成功的關(guān)鍵在于具有特異性的DNA探針和ISHH的偵檢程序,比如染色體的拷貝數(shù)與腫瘤細(xì)胞前處理的方法有關(guān),如移除蛋白質(zhì)不徹底,就會使偵檢到的染色體拷貝數(shù)減少。又如在切片上進(jìn)行細(xì)胞間期染色體的ISHH時,常見到一些細(xì)胞核碎片呈不同形狀的斑點狀(在涂片上不會出現(xiàn)此種圖像)。對ISHH所獲得資料的分析,須經(jīng)過反復(fù)的實踐,比如模糊的或分裂的斑點可以是非整倍體(aneuoploidy)的假陽性反應(yīng),產(chǎn)生于細(xì)胞周期的G2期。

四、利用性染色體特異性DNA探針的ISHH技術(shù)

(一)基本原理

利用性染色體X或Y的特異性DNA探針的ISHH技術(shù)進(jìn)行胎兒生前(Prenatal)性別的診斷,樣品取自于羊水、絨毛或胎兒的血液。近年,科技工作者又成功地進(jìn)行了胚前(pre-embry-o)或植入前(preimplantation)的ISHH診斷。所謂胚前診斷是在受精卵植入子宮內(nèi)膜前的4~6細(xì)胞期,以顯微操縱器(micromanipulator)或微型吸管穿破透明帶,將分裂球或其中的部分細(xì)胞吸出放入培養(yǎng)液內(nèi),應(yīng)用ISHH技術(shù)進(jìn)行性染色體的分析,如有染色體畸形,可及早移除,避免以后進(jìn)行人工流產(chǎn)術(shù)。本技術(shù)可還用于鑒別精子是帶X或Y染色體。如果1個婦女遺傳性基因是與X染色體相聯(lián)系的,那么可給予人工授精只帶X染色體的精子以避免其子代有遺傳疾病的危險。當(dāng)然帶X染色體的精子的分離技術(shù)還有待于研究和建立。目前這還是一種實驗性設(shè)想。羊水可在16~20周妊娠期吸取。在18~19周時,20ml的羊水內(nèi)大約含100萬個細(xì)胞,含大約7μgDNA。絨毛膜的絨毛可在3~6月取,每次可獲5~50mg的組織。應(yīng)注意在應(yīng)用前清除母體細(xì)胞。胎血0.2~0.7ml可在17~40周采取,在15~21周,胎血中含2×109白細(xì)胞/L和類似數(shù)量的有核紅細(xì)胞(Miller et al, 1985)。在32~34周,有核紅細(xì)胞的比例數(shù)降至0~50/每100個白細(xì)胞。這種以性染色體為探針的ISHH技術(shù),可應(yīng)用于分裂中期的染色體鋪片上,也可以應(yīng)用于間期細(xì)胞核制片。性染色體ISHH技術(shù)在下列場合特別有用,如(1)當(dāng)無足夠的分裂細(xì)胞供可靠的細(xì)胞遺傳學(xué)分析時;(2)當(dāng)胎兒面臨性染色體連鎖遺傳性疾病的危險而需做迅速的性別確定時;(3)協(xié)助鑒別45,X/46,XY鑲嵌和其它異常染色體的鑲嵌類型;(4)當(dāng)一雌性具有一Y染色體的雜交時,應(yīng)檢查其父母的血樣品,因為在正常情況下有部分的雄性具有2個Y染色體。這里只敘述了性染色體在ISHH技術(shù)的應(yīng)用,如用同樣技術(shù)標(biāo)記其它染色體也可能對其它遺傳性疾病進(jìn)行診斷,如Julien等(1986)曾應(yīng)用染色體21號DNA探針于間期細(xì)胞核,出現(xiàn)3倍體,為常見遺傳性疾病Down氏綜合征的診斷特征(發(fā)病率為1/700出生者),同樣,在Edward氏綜合癥(遺傳性疾病出現(xiàn)率1/3000出生者)顯示18號染色體為3倍體。West實驗室進(jìn)行了大量的性染色體的ISHH實驗,并比較了各種標(biāo)記物的優(yōu)缺點,他經(jīng)反復(fù)實驗后承認(rèn)非放射性同位素標(biāo)記物如生物素、地高辛具有許多優(yōu)點,但在性染色體的ISHH顯示,他認(rèn)為至少在他的實驗室同位素3H的標(biāo)記優(yōu)于其它的標(biāo)記物。

(二)基本操作方法

1.Y染色體3H標(biāo)記DNA探針原位雜交技術(shù)

(1)探針標(biāo)記,以3H標(biāo)記Y染色體DNA探針(詳見第19章 )。

(2)原位雜交

①RNA酶的前處理:取1ml RNA酶保存液(10mg/ml)于250ml 2×SSC內(nèi),預(yù)熱于37℃水浴中。選具有適量的細(xì)胞分布的載片孵育于稀釋的RNA酶溶液中,37℃,1h。系列等級乙醇脫水,70%,90%,100%乙醇各2min,空氣干燥。

②相當(dāng)250ml的預(yù)雜交液(含70%甲酰胺,0.6×SSC配),70℃水浴。置載片于此預(yù)雜交液內(nèi)2min以使靶DNA變性,如(1)經(jīng)系列等級乙醇脫水,空氣干燥。

③DNA探針準(zhǔn)備與變性

雜交液:10×SSC20%

tRNA  10%

甲酰胺 50%

硫酸葡聚糖 20%

DNA探針-3H 20%

均勻混合,70℃水浴5min使探針變性,然后迅速置冰上冷卻。

10×SSC:1.2mmol/L NaCl

0.15mmol/L醋酸鈉

0.2mol/L NaPO4

tRNA(SigmaR1759)4mg/ml(用TE緩沖液配),-4℃保存。

TE緩沖液:10mmol/L Tris,1mmol/L EDTA,Ph7.5。

每張載片加20μl含探針的雜交液,覆以蓋玻片,四周用橡皮泥封固,于37℃孵育過夜。可測定3H的放射比性,以了解每張載片的探針含量。

④雜交后漂洗,次日移除蓋玻片,用緩沖液39℃漂洗

50%甲酰胺1×SSC 4×5min

1×SSC  39℃  4×5min

⑤系列等級乙醇脫水,70%,90%,100%各2min,空氣干燥。

(3)放射自顯影(詳見二十章 第一節(jié) ):浸入核乳膠,暗盒于冷室或4℃冰箱儲存,顯影,定影,復(fù)染,封固和觀察。應(yīng)用3H標(biāo)記pHY2.1DNA探針,其曝光時間大約為6~7日。

2.雜交前精子的處理

(1)取1ml用緩沖液清洗過的精子,加1ml 6mmol/L EDIT(60μl 0.2mol/L EDTA加1940μl的BWW培養(yǎng)基)。留置于室溫5~10min,離心(1000rpm(175×g)5min。

(2)棄上清液,沉淀的精子內(nèi)加1ml 2mmol/L DTT(dithiothretiol, DTT,二硫蘇糖醇),配法:154μl的DTT加1846μl(4g/ml)BWW培養(yǎng)基(Gibbers et al, 1971),置室溫45min,再離心1000rpm 5min。

(3)棄上清液,用BWW培養(yǎng)基再稀釋、離心。

(4)加新鮮配制固定劑(甲醇:醋本以=3:1),反復(fù)混勻或置于漩渦式的混勻器上混勻,室溫30~60min,離心。

(5)加數(shù)滴新鮮固定劑于離心管中,如上再混勻。迅速從混勻液中取2~3滴精液滴于載玻片上,空氣干燥,以相差顯微鏡檢查確有精子存在,保存在清潔的干盒中備用。

(6)在ISHH以前,取出載片,加數(shù)滴0.05% SDS(20μl 0.05% SDS/每2ml BWW培養(yǎng)基),靜置5min,傾去SDS(十二烷基磺酸鈉,配制法見附錄2),以2×SSC漂洗,系列等級乙醇脫水,70%,90%,100%各2min,空氣干燥。

(7)雜交步驟同上,雜交后以0.5%伊紅黃(Eosin yellow)復(fù)染,自來水沖洗,空氣干燥,DPX封固。

本節(jié) 簡要介紹了ISHH技術(shù)在染色體鋪片應(yīng)用的三個方面,并摘要介紹了它們的應(yīng)用及操作方法。由于這一技術(shù)在國際上也處于剛起步階段,其發(fā)展主要在近10年,國內(nèi)尚未開展,因此,此一技術(shù)的應(yīng)用還有待于不斷的摸索與完善。必須說明的是ISHH在染色體制片的應(yīng)用也需設(shè)置對照實驗組(詳見第二十章 第一節(jié))。

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