當(dāng)病原體進入了體內(nèi)，又擺脫了吞噬細胞的吞噬，可隨血液循環(huán)而在全身播散，但體內(nèi)某些部位，由于結(jié)構(gòu)上的特點，使病原體不能透過而發(fā)揮局部性的屏障作用，它也屬于非特異性的免疫作用。這種屏障有多種，如血腦屏障、血胎屏障、血眼屏障、血胸腺屏障等，這里重點介紹前二種。
血腦屏障；由腦膜、腦的毛細血管和包在它外面的膠質(zhì)膜組成的血腦屏障，可以阻止病原體從血流侵入到腦和脊髓，保護中樞神經(jīng)系統(tǒng)。有些病菌不易引起腦部疾病就是這個道理，只有在血腦屏障被破壞后，或者有些病菌可突破血腦屏障進入腦部才引起腦炎。嬰兒或幼年期因血腦屏障尚未充分發(fā)育，病原體可隨血入腦，所以易患腦脊髓炎及腦炎。
血胎屏障：由母方子宮內(nèi)膜和胎方的絨毛膜構(gòu)成血胎屏障，它可保護胎兒免受病原體感染，保持胎兒正常發(fā)育。這種屏障作用的強弱與胎齡有關(guān)，如果母親懷孕不足三個月時，受到某些病毒（如風(fēng)疹、肝炎等病毒)的感染，由于血胎屏障還沒有健康完善，這種病毒就能通過胎盤引起胎兒感染。胎兒發(fā)病后停止發(fā)育或者死產(chǎn)或者流產(chǎn)，即使發(fā)育成熟，也可能發(fā)生脊椎裂、兔唇等畸形。如果懷孕四個月以上再得風(fēng)疹等病毒感染，病毒就不能通過胎盤，胎兒也就不會發(fā)生畸形。不少藥物也能通過胎盤，造成畸胎、死胎或流產(chǎn)，所以懷孕期間尤其是懷孕早期要注意保健，預(yù)防病毒感染并防止濫用藥物是十分重要的。
