表3-2 免疫球蛋白基因定位
編碼多肽鏈 | 基因符號(hào)(人) | 基因定位(染色體) | |
人 | 小鼠 | ||
κ輕鏈 | IGK | 2p11 | 6 |
λ輕鏈 | IGL | 22q11 | 16 |
H重鏈 | IGH | 14q32.3 | 12 |
免疫球蛋白(Ig)的分子由IGK、IGL和IGH基因編碼。IGK、IGL和IGH基因定位于不同的染色體(表3-2)。編碼一條Ig多肽鏈的基因是由胚系中數(shù)個(gè)分隔開的DNA片段(基因片段)經(jīng)重排而形成。1965年Dreyer和Bennet首先提出假說,認(rèn)為Ig的V區(qū)和C區(qū)由分隔存在的基因所編碼,在淋巴細(xì)胞發(fā)育過程中這兩個(gè)基因發(fā)生易位而重排在一起。1976年Hozumi和Tonegawa應(yīng)用DNA重組技術(shù)證實(shí)了這一假說。
Ig重鏈基因是由V、D、J和C四種不同基因片段所組成。
(一)Ig重鏈可變區(qū)(V區(qū))基因
重鏈可變區(qū)基因是由V、D、J三種基因片段經(jīng)重排后所形成。
1.重鏈V區(qū)基因的組成 編碼重鏈V區(qū)基因長約1000~2000kb,包括V、D、J三組基因片段。
(1)重鏈V基因片段:小鼠VH基因片段數(shù)目為250~100zxtf.net.cn/yishi/0個(gè)。根據(jù)VH基因片段核酸序列的相似性(>80%同源性),至少可分為11個(gè)家族(family).人V基因片段約為100個(gè),至少可分為6個(gè)家族,每個(gè)家族含有2~60個(gè)成員不等。V基因片段由2個(gè)編碼區(qū)(codingregions)組成:第一個(gè)編碼區(qū)編碼大部分信號(hào)序列;第二個(gè)編碼區(qū)編碼信號(hào)序列羧基端側(cè)的4個(gè)氨基酸殘基和可變區(qū)約98個(gè)氨基酸殘基,包括互補(bǔ)決定區(qū)1和2(complementarity determining region 1和2,CDR1和CDR2)。
(2)重鏈D基因片段:D(diversity)是指多樣性。DH基因片段僅存在于重鏈基因中而不存在于輕鏈基因。D基因片段編碼重鏈V區(qū)大部分CDR3。小鼠DH共有12個(gè)片段,位于VH和JH基因片段之間,大部分DH片段較為集中,約占60~80kb,但靠上游的DH可能位于VH區(qū)域內(nèi),最后一個(gè)DH片段與JH基因5"端相距約0.7kb。人類DH片段可能有10~20個(gè)左右。
(3)重鏈的J基因片段:J(joining)指連接,是連接V和C基因片段。JH編碼約15~17個(gè)氨基酸殘基,包括重鏈V區(qū)CDR3除DH編碼外的其余部分和第4骨架區(qū)。小鼠JH基因片段有4個(gè),與Cμ相距約6.5kb。人有9個(gè)JH,其中6個(gè)是有功能的JH基因片段。
V、D、J基因片段經(jīng)重組連接在一起,組成2個(gè)外顯子,一個(gè)外顯子編碼信號(hào)序列的大部分,另一個(gè)外顯子編碼信號(hào)序列的其余部分和重鏈可變區(qū)。
小鼠和人在胚系中Ig基因的結(jié)構(gòu)見圖3-4和圖3-5。
2.重鏈可變區(qū)基因的移位 在重鏈基因重排開始時(shí),二條染色體上都發(fā)生D基因片段移位到J基因片段而發(fā)生D-J基因連接。在此以后,只有其中一條染色體上的V基因片段與D-J基因片段連接。VH基因片段5"端含有啟動(dòng)子(promoter),JH和Cμ基因片段之間的內(nèi)含子中含有轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子(transcriptinalenhancer)。如果一條染色體VH基因與D-J基因重排無效(non-productive),另一條染色體的VH基因片段開始發(fā)生移位,與D-J基因片段連接。
某些與Ig基因片段重排有關(guān)的特殊序列稱為識(shí)別序列(recognition sequences),位于V基因片段的3"端與J基因片段的5"端之間以及D基因片段的兩側(cè)。V基因片段3"端、J基因片段5"端以及D基因片段的兩側(cè)也是DNA重排識(shí)別信號(hào)所在區(qū)域,這些識(shí)別信號(hào)包括三部分:(1)高度保守的回文結(jié)構(gòu)的七聚體(palindromic heptamer);(2)較少保守、富含A/T的九聚體(nonamer);(3)七聚體和九聚體之間不保守的間隔序列(spacer sequence),含有12±1堿基對(duì)或23±1堿基對(duì)。根據(jù)12/23堿基對(duì)間隔規(guī)則(或稱1圈/2圈定律),兩個(gè)基因片段的重組僅發(fā)生在兩個(gè)基因片段之間:各有一個(gè)12個(gè)堿基對(duì)片段和一個(gè)23個(gè)堿基對(duì)片段的結(jié)構(gòu)(圖3-6)。
圖3-4 小鼠Ig基因結(jié)構(gòu)
注:(1)L:先導(dǎo)序列基因片段 V:可變區(qū)基因片段 D:D基因片段
J:J基因片段 C:恒定區(qū)基因片段 E:轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子
S:轉(zhuǎn)換區(qū) *:假基因
(2)內(nèi)含子區(qū)域所標(biāo)數(shù)字表示DNA長度(kb)。
(3)每個(gè)CH基因用一個(gè)方框表示,實(shí)際上包括幾個(gè)外顯子,如Cμ含有6個(gè)外顯子。
(4)λ基因增強(qiáng)子位于Cλ4和Cλ1基因片段的下游。
圖3-5 人Ig基因結(jié)構(gòu)
注:(1)L:先導(dǎo)序列基因片段 V:可變區(qū)基因片段 D:D基因片段
J:J基因片段 C:恒定區(qū)基因片 *:假基因
(2)內(nèi)含子區(qū)域所標(biāo)數(shù)字表示DNA長度(kb)
(3)每個(gè)CH基因用一個(gè)方框表示,實(shí)際上包括幾個(gè)外顯子
參與V/(D)/J基因重組過程的酶稱為V/(D)/J重組酶(recombinase),有關(guān)于執(zhí)行識(shí)別、切割和重新連接基因片段重組酶的純化和鑒定工作還剛開始。重組酶實(shí)際上包括重組過程中多種酶的活性。最近在前B細(xì)胞(pre-b cell)中已經(jīng)鑒定出兩種刺激Ig基因重排的基因,稱為重組激活基因1(recombinationactivating gene 1,RAG-1)和重組激活基因2(RAG-2),其確切的作用機(jī)理還不太清楚。重組酶作用的特點(diǎn)是:(1)淋巴細(xì)胞特異性的,非淋巴樣細(xì)胞如成纖維細(xì)胞無重組酶活性,這可能解釋了Ig基因的重排僅見于B淋巴細(xì)胞。目前一般認(rèn)為T細(xì)胞TCR基因重排中的重組酶與B細(xì)胞中重組酶相同或相似。(2)重組酶發(fā)揮其功能僅限于B細(xì)胞發(fā)育早期,未成熟B細(xì)胞如前B細(xì)胞(pre-b cell)細(xì)胞系重組酶活性很高,但抗體生成細(xì)胞或骨髓瘤細(xì)胞無明顯重組酶活性,因此時(shí)B細(xì)胞已經(jīng)分泌某一特異性抗體,不再發(fā)生重排其它的Ig基因,因此也不會(huì)改變?cè)人a(chǎn)生抗體的特異性。轉(zhuǎn)換重組酶(switch recom-binase)可能與VDJ重組酶(VDJ recombinase)相似,但缺乏七聚體/九聚體(heptamer/nonamer)識(shí)別蛋白。重組酶功能異?蓪(dǎo)致機(jī)體不能產(chǎn)生Ig和TCR,很可能與重癥聯(lián)合免疫缺陷(severe combinedimmunodeficiency,SCID)的發(fā)生有關(guān)。例如SCID小鼠16號(hào)染色體著絲點(diǎn)末端存在一個(gè)scid基因,為單基因常染色體遺傳基因。scid基因純合將影響DNA重組酶的識(shí)別功能,在TCR或BCR基因片段重排時(shí)不能識(shí)別正確的位點(diǎn),使T細(xì)胞、B細(xì)胞在淋巴干細(xì)胞發(fā)育早期即夭折,導(dǎo)致重癥聯(lián)合免疫缺陷。
圖3-6 參與Ig基因重排組酶識(shí)別的DNA序列
(二)Ig重鏈恒定區(qū)(C區(qū))基因
1.重鏈C基因片段 重鏈恒定區(qū)基因由多個(gè)外顯子組成,位于J基因片段的下游,至少相隔1.3kb。每1個(gè)外顯子編碼1個(gè)結(jié)構(gòu)域(domain),鉸鏈區(qū)(hinge region)是由單獨(dú)的外顯子所編碼,但α重鏈的鉸鏈區(qū)是由CH2外顯子的5"端所編碼。大多分泌的Ig重鏈羧基端片段或稱尾端“tail piece”是由最后一個(gè)CH外顯子的3"端所編碼,而δ鏈的“tailpiece”是由一個(gè)單獨(dú)的外顯子所編碼。小鼠CH基因約占2000kb,其外顯子從5"端到3"排列的順序是Cμ-Cδ-Cγ3-Cγ1-Cγ2b-Cγ2a-Cε-Cα。人CH基因外顯子排列的順序是Cμ-Cδ-Cγ3-Cγ1-Cε2(pseudo基因)Cα1-Cγ2-Cγ4-Cε1-Cα2。其中基因片段Cγ3-Cγ1-Cε2-Cα1和基因片段Cγ2-Cγ4-Cε1-Cα2可能是一個(gè)片段經(jīng)過一次復(fù)制而得,為研究CH基因的起源和進(jìn)化提供有用的依據(jù)。
2.免疫球蛋白類型轉(zhuǎn)換 1964年Nossal等發(fā)現(xiàn)B淋巴細(xì)胞存在著類型的轉(zhuǎn)換。Ig類型轉(zhuǎn)換(class switch)或稱同種型轉(zhuǎn)換(isotype switch)是指一個(gè)B淋巴細(xì)胞克隆在分化過程中VH基因片段保持不變,而發(fā)生CH基因節(jié)段的重排、比較CH基因片段重排后基因編碼的產(chǎn)物,V區(qū)相同而C區(qū)不同,即識(shí)別抗原特異性不變,而類或亞類發(fā)生改變。這種類型轉(zhuǎn)換在無明顯誘因下可自發(fā)產(chǎn)生。
局部微環(huán)境和細(xì)胞因子可影響和調(diào)節(jié)免疫球蛋白類型的轉(zhuǎn)換,如在腸道派伊爾氏結(jié)的B細(xì)胞V基因片段優(yōu)先轉(zhuǎn)換到Cα1進(jìn)行重排,因此主要合成和分泌IgA。在體外向經(jīng)LPS刺激的小鼠B細(xì)胞中加入IL-4,可促進(jìn)B細(xì)胞產(chǎn)生IgG1和IgE,抑制IgG2b產(chǎn)生;低濃度的IL-4主要誘導(dǎo)產(chǎn)生IgG1,高濃度IL-4主要誘導(dǎo)產(chǎn)生IgE。面IFN-γ則誘導(dǎo)小鼠B細(xì)胞合成IgG2a,抑制IgE的產(chǎn)生。TGF-β、IL-5和IL-6對(duì)IgA的產(chǎn)生具有促進(jìn)作用(表3-3)。細(xì)胞因子調(diào)節(jié)B細(xì)胞Ig類別轉(zhuǎn)換的機(jī)理可能是:(1)刺激某些細(xì)胞的克隆選擇性的增殖,使分泌某特定類、亞類抗體的克隆細(xì)胞增加,如IL-5、IL-6促進(jìn)IgA。產(chǎn)生除通過同種型轉(zhuǎn)換進(jìn)行調(diào)節(jié)外,還可選擇性促進(jìn)IgA定向細(xì)胞分化增殖為IgA分泌細(xì)胞。(2)通過誘導(dǎo)特定位置上兩個(gè)轉(zhuǎn)換區(qū)的重組,誘導(dǎo)B細(xì)胞由分泌IgM向某一同種型Ig轉(zhuǎn)換。如高濃度IL-4促進(jìn)LPS誘導(dǎo)小鼠B細(xì)胞產(chǎn)生IgE,主要是使Cε轉(zhuǎn)換區(qū)與重組酶的接近(accessibility),通過同種型轉(zhuǎn)換促進(jìn)IgE的產(chǎn)生。
表3-3 細(xì)胞因子對(duì)LPS誘導(dǎo)的Ig類和
亞類轉(zhuǎn)換的調(diào)節(jié)作用(占總Ig%)
細(xì)胞因子 | IgM | IgG1 | IgG2a | IgE | IgA |
對(duì)照(不加外源性細(xì)胞因子) | 85 | 2 | <1 | <1 | <1 |
IL-4 | 70 | 20 | <1 | 5 | <1 |
IFN-γ | 80 | 2 | 10 | <1 | <1 |
THF-β和IL-2 | 75 | 2 | <1 | <1 | 15 |
注:(1)純化的小鼠IgM+IgD+B細(xì)胞體外培養(yǎng)時(shí),加入不同的細(xì)胞因子和LPS,然后檢 LPS,然后檢測(cè)不同類或亞類免疫球蛋白的百分比。
(2)由于未檢測(cè)所有類和亞類Ig,所以每組Ig總百分比不到或接近100%。
Ig類型轉(zhuǎn)換可能通過以下兩種機(jī)理。
(1)缺失模型(deletion model):又稱linear orderly deletiom ofH chain genes。以小鼠CH基因?yàn)槔,如Cμ和Cδ基因片段被缺失,那么先前重排的VDJ就會(huì)按照順序與下一個(gè)CH基因即Cγ3發(fā)生重排,經(jīng)轉(zhuǎn)錄和翻譯后,編碼γ3重鏈;如缺失所有的γ鏈亞類基因,依次會(huì)產(chǎn)生ε鏈。上述模型在被刺激后小鼠B細(xì)胞在體外培養(yǎng)中產(chǎn)生Ig類別的順序得到證實(shí),即先產(chǎn)生IgM,然后依次產(chǎn)生IgG3和IgG1等。但這個(gè)模型不能解釋免疫動(dòng)物或抗原刺激B細(xì)胞培養(yǎng)中單個(gè)B細(xì)胞可同時(shí)表達(dá)幾種不同類或亞類的重鏈。
(2)RNA的不同剪接:除DNA水平的Ig類型轉(zhuǎn)換形成外,RNA水平的不同剪接(alternative RNA splicing)也可產(chǎn)生不同的Ig類型。 Cμ和Cδ基因片段之間無S區(qū),IgM和IgD共表達(dá)的B細(xì)胞系DNA分析表明,Cμ和Cδ基因片段沒有發(fā)生重排,相同的VH出現(xiàn)在μ或δ鏈的mRNA上,表明它們可能有一個(gè)共同的mRNA前體,通過不同的或差異剪接(differential splicing)分別形成μ鏈和δ鏈mRNA。初級(jí)RNA轉(zhuǎn)錄本(primary RNa transcript)是由VDJ復(fù)合體連接Cμ和Cδ基因片段經(jīng)轉(zhuǎn)錄后形成。如果在剪接過程中切除初級(jí)RNA轉(zhuǎn)錄本中的Cδ部分,經(jīng)加工后形成μmRNA;如去除初級(jí)RNA轉(zhuǎn)錄本中的Cμ部分,則加工后形成δmRNA。這兩種mRNA分別被翻譯,使單個(gè)B細(xì)胞同時(shí)產(chǎn)生μ和δ鏈,同時(shí)表達(dá)IgM和IgD。同樣的機(jī)理可從一條長的primary RNA轉(zhuǎn)錄本中加工為 μmRNA和εmRNA(或其它重鏈mRNA),同時(shí)表達(dá)IgM、IgE或其它類Ig。
圖3-7 Ig類型轉(zhuǎn)換缺失模型
(三)膜表面Ig重鏈基因
膜表面Ig(mIg)重鏈基因的外顯子結(jié)構(gòu)與分泌性Ig重鏈的基因外顯子結(jié)構(gòu)基本相同,但在基因組的3"端有所不同。作為識(shí)別抗原受體的mIg,其重鏈羧基端有一段疏水性氨基酸插入到胞膜雙層脂質(zhì)中,mIg重鏈的轉(zhuǎn)錄本要比分泌性重鏈轉(zhuǎn)錄本多1~2個(gè)外顯子,與分泌性重鏈基因最后一個(gè)外顯子至少相隔1.4kb,這1~2個(gè)外顯子編碼重鏈的羧基端部分,這部分氨基酸殘基的數(shù)目視重鏈不同而有所差異,如鼠或人mIgμ鏈的這一部分約為41個(gè)氨基酸殘基,而鼠mIgε鏈這部分卻有72個(gè)氨基酸殘基。這個(gè)區(qū)域可分為三個(gè)部分:(1)一個(gè)酸性間隔子,靠氨基端側(cè),與最后一個(gè)CH結(jié)構(gòu)域相連,位于細(xì)胞膜外側(cè);(2)跨膜部分,由26個(gè)不帶電荷的疏水氨基酸形成一個(gè)α螺旋,穿過胞膜的脂質(zhì)雙層;(3)胞漿內(nèi)羧基端部分,3~28個(gè)氨基酸殘基不等,可能與信號(hào)傳遞有關(guān)。
圖3-8 RNA的差異拼接與IgM和IgD共同表達(dá)在一個(gè)B細(xì)胞上
分泌形式的μ、α和δ重鏈最后一個(gè)結(jié)構(gòu)域后有一段額外延長的由帶電荷氨基酸組成的序列,稱為尾片(tail pieces),約含20個(gè)氨基酸,在IgM和IgA分子中,單體Ig尾片通過二硫鍵相互連接或與J鏈形成二聚體或多聚體。分泌形式μ鏈的mRNA含有V、D、J、Cμ1、Cμ2、Cμ3、Cμ4和Cμ43"端一個(gè)小的外顯子轉(zhuǎn)錄區(qū)。
Ig重鏈基因除L、V、D、J和C基因片段外,在內(nèi)含子中還有一些與mRNA轉(zhuǎn)錄和免疫球蛋白類的轉(zhuǎn)換有關(guān)的結(jié)構(gòu)。
(1)插入順序(intervening sepuence,IS):有IS1、IS2、IS3……等。
(2)轉(zhuǎn)換區(qū)序列:即S區(qū)(switch region)。除Cδ外,各個(gè)恒定區(qū)基因片段上游都有一個(gè)同源重復(fù)序列的S區(qū),約占2~10kb,分別命名為Sμ、Sγ、Sα和Sε等,與Ig類和亞類的轉(zhuǎn)換有關(guān)。S區(qū)含有眾多串聯(lián)的高度保守的DNA重復(fù)序列,每個(gè)重復(fù)序列可長到52bp,其確切的功能還不清楚。如Sμ的結(jié)構(gòu)為[(GAGCT)nGGGGT]m,n一般為2~5,但有時(shí)可達(dá)17,m可達(dá)150。目前關(guān)于H鏈轉(zhuǎn)換區(qū)的研究主要以小鼠為模型,如4個(gè)Sγ是由49bp長的基序的重復(fù)序列所組成。Sα至少由長為80pb的15個(gè)重復(fù)序列,Sε的重復(fù)序列長為60bp。在小鼠,B淋巴細(xì)胞經(jīng)T細(xì)胞非依賴性活化后常發(fā)生Sμ/Sγ3和Sμ/Sγ2b的重組,因此在無T細(xì)胞存在條件下,LPS活化小鼠B細(xì)胞成為淋巴母細(xì)胞,主要轉(zhuǎn)換Ig的亞類為IgG3和IgG2b。
(3)啟動(dòng)子:靠近每個(gè)V基因轉(zhuǎn)錄位點(diǎn)的上游,含有TATA盒,控制RNA多聚酶Ⅱ作用下的轉(zhuǎn)錄過程。大多數(shù)Ig的啟動(dòng)子含有許多DNA序列,包括一個(gè)保守的8個(gè)核苷酸序列,可能是核DNA結(jié)合蛋白(nuclear DNA-binding proteins)結(jié)合部位,在轉(zhuǎn)錄過程中起著重要作用。由于核DNA結(jié)合蛋白是由其它基因所編碼,因此這種作zxtf.net.cn用方式被稱為反式作用(transacting).
圖3-9 膜表面和分泌的Igμ基因及μ鏈羧基端結(jié)構(gòu)的比較
注:(a)初級(jí)RNA轉(zhuǎn)錄本通過不同的剪接加工,分別形成分泌型μmRNA和膜型μmRNA。
(b)蘇氨酸(T)為Cμ4第556位氨基酸。膜表面μ重鏈的556氨基酸后還有41個(gè)氨基酸,其中富含帶負(fù)電氨基酸胞膜外區(qū)12個(gè)氨基酸,26個(gè)疏水性氨基酸組成的穿膜區(qū)以及胞漿區(qū)3個(gè)氨基酸;分泌型μ重鏈在556位氨基酸后有20個(gè)氨基酸組成的尾片,C末端倒數(shù)第二個(gè)為半胱氨酸。
(4)增強(qiáng)子(E):在人和小鼠和重鏈和κ輕鏈中發(fā)現(xiàn)有增強(qiáng)子,其核苷酸序列為TGGTAAG。在H鏈基因中,增強(qiáng)子位于JH3"端側(cè)。當(dāng)H鏈VDJ或κ鏈VJ重排后,V基因上游的啟動(dòng)子靠近增強(qiáng)子,使V(D)JC基因重排后開始更為有效的轉(zhuǎn)錄。增強(qiáng)子作用方式與啟動(dòng)子不同,呈方向非依賴方式(orientation-independent manner),即增強(qiáng)子可作用于被轉(zhuǎn)錄基因的上游或下游。此外,增強(qiáng)子的作用是細(xì)胞特異性。
已重排Ig基因的轉(zhuǎn)錄起始于TATA盒下游約20核苷酸處,轉(zhuǎn)錄至C基因后,產(chǎn)生初級(jí)RNA(primary RNA)轉(zhuǎn)錄本,在3"端切斷后進(jìn)行多聚腺苷酸化(polyadenylation),剪接掉不編碼的內(nèi)容含子,如J區(qū)與C區(qū)之間的不編碼序列是在RNA水平上被剪接掉。
圖3-10 小鼠μ鏈的基因重排順序、轉(zhuǎn)錄和合成
(四)重鏈基因重排、轉(zhuǎn)錄和多肽鏈的合成。
以μ鏈基因的重排順序、轉(zhuǎn)錄和μ鏈合成為例,見圖3-10。
在Ig重鏈基因重排后,輕鏈的可變區(qū)基因片段隨之發(fā)生重排,V與J基因片段并列在一起。κ輕鏈基因先發(fā)生重排,如果κ基因重排無效,隨即發(fā)生λ基因的重排。
(一)κ鏈基因的結(jié)構(gòu)和重排
在小鼠,Vκ基因片段約有250個(gè),間隔距離平均為10~12kb;Jκ有5個(gè),其中4個(gè)有功能:Cκ只有1個(gè)。在人類,Vκ基因片段約有85~100個(gè),編碼V區(qū)氨基端的1~95位氨基酸,包括CDR1、CDR2和部分CDR3。根據(jù)DNA相似性程度,Vκ可分為16個(gè)組。在胚系DNA水平上,Vκ基因片段分散約占2000kb之長,占人2號(hào)染色體長度的百分之一左右。Jκ基因片段有5個(gè),編碼第96~108氨基酸。Jκ與最后一個(gè)Vκ基因片段的3′端相距為23kb,但與Cκ外顯子靠得較近。Cκ也只有1個(gè),編碼C區(qū)(109~214氨基酸),所有κ輕鏈具有同一結(jié)構(gòu)的C區(qū)。人和鼠Cκ距最后一個(gè)Jκ基因片段約2.5kb。Vκ與Cκ之間以隨機(jī)的方式發(fā)生重組連接。人κ輕鏈V基因的排列多樣性約為100Vκ×5Jκ=500。
(二)λ鏈基因的結(jié)構(gòu)和重排
小鼠Igλ輕鏈基因結(jié)構(gòu)見表3-4。在大多數(shù)近交系小鼠中,有4個(gè)Jλ和4個(gè)Cλ,根據(jù)其在胚系DNA上的分布位置可分為兩組(cluster):Jλ2Cλ2Jλ4Cλ4(C2-C4組)和Jλ3Cλ3Jλ1Cλ1(C3-C1組),每組基因片段長約為5kb。
表3-4 λ鏈基因結(jié)構(gòu)和編碼的氨基酸
分類 | 名稱 | 在基因片段中的位置 | 編碼氨基酸在輕鏈中的位置 | 編碼氨基酸數(shù) |
先導(dǎo)序列基因片段 | ||||
L1 | 基因組5′端 | 第-19~-5先導(dǎo)肽段 | 15 | |
外顯子 | L2 | 緊接V基因5′端 | 第-4~-1先導(dǎo)肽段 | 4 |
V基因片段 | L2的3′端 | V區(qū)1~96或98 | 96或98 | |
J基因片段 | V基因片段3′端 | V區(qū)97或99~112 | 14或16 | |
C基因片段 | J基因片段3′端 | C區(qū)113~214 | 102 | |
內(nèi)含子 | IS1 | 在L1與L2之間 | 93 bp | (不編碼) |
IS2 | J與C之間 | 1205 bp | (不編碼) |
λ基因組中共含有Vλ1、Vλ2和Vλx3個(gè)Vλ基因片段,Vλ2與“C2-C4組”(Jλ2Cλ2Jλ4Cλ4)的5′端相距73kb;Vλ1與“C3-C1組”(Jλ3Cλ3Jλ1Cλ1)相距19kb;VλX與Vλ23′端相距19kb;Vλ重因片段與Jλ、Cλ基因片段的連接并不完全隨機(jī),Vλ1與Jλ3或J1重排,組成Vλ1Jλ3Cλ3基因或Vλ1Jλ1Cλ1基因,而Vλ2似乎只與Jλ2重排組成Vλ2Jλ2Cλ2基因,偶爾可見Vλ2與Jλ3或Jλ1重排,分別組成Vλ2Jλ3Cλ3基因和Vλ2Jλ1Cλ1基因。Jλ4、Cλ4不具備功能。目前尚未發(fā)現(xiàn)Vλ1與Jλ2重排。VλX只發(fā)現(xiàn)與Jλ2重排。
在人類,λ基因位于第22號(hào)染色體,Vλ約有100個(gè),不同亞型含Cλ數(shù)量在6~9個(gè)之間,每個(gè)Cλ與各自的Jλ基因片段相鄰。λ輕鏈的轉(zhuǎn)錄過程是某一個(gè)Vλ基因片段與某一個(gè)Jλ片段連接成Vλ/Jλ外顯子,然后與鄰近Cλ基因片段重組轉(zhuǎn)錄為初級(jí)mRNA,再通過mRNA的剪接、翻譯及修飾,成為成熟的λ輕鏈。
圖3-11 小鼠κ輕鏈基因重排順序、轉(zhuǎn)錄和合成
(一)核因子對(duì)Ig基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)節(jié)作用
Ig基因轉(zhuǎn)錄活性是由兩個(gè)順式作用組件(cis-acting elements)即啟動(dòng)子(promoter,P)和增強(qiáng)子(enhancer,E)來調(diào)節(jié)。而啟動(dòng)子和增強(qiáng)子的功能又由反式作用的核因子(trans-acting nuclear factor)所控制。這些核因子也稱為DNA結(jié)合蛋白(DNA-binding proteins,DBP),結(jié)合到啟動(dòng)子或增強(qiáng)子內(nèi)特異的核苷酸序列,從而抑制或刺激啟動(dòng)子和增強(qiáng)子的活性。許多種類細(xì)胞受到某些刺激后可誘導(dǎo)或活化特定的DBP。
1.ATGCAAAT序列及其核因子 Ig重鏈啟動(dòng)子含有8個(gè)保守的核苷酸序列ATGCAAAT,這個(gè)序列也存在于κ輕鏈的啟動(dòng)子、重鏈增強(qiáng)子以及許多非Ig的啟動(dòng)子中。B細(xì)胞Ig基因的轉(zhuǎn)錄依賴于啟動(dòng)子中這一完整的ATGCAAAT序列的存在。哺乳動(dòng)物細(xì)胞中至少存在三種特異性結(jié)合ATGCAAAT的蛋白質(zhì),即Oct1、Oct2(OTF2A)和OTF2B。Oct1又稱OTF1(octamer transcription factor 1),廣泛存在于哺乳動(dòng)物的細(xì)胞中;OTF2A和OTF2B為淋巴細(xì)胞特異性,活化Ig基因的轉(zhuǎn)錄。
2.GGGACTTTCC序列和NF-κB 小鼠κ鏈增強(qiáng)子含有GGGACTTTCC10bp 的序列,是一種稱之為NF-κB(nuclearfactor of kappa B)DNA結(jié)合蛋白結(jié)合的靶序列。
(1)NF-κB結(jié)合靶序列的分布:NF-κB結(jié)合的DNA序列也存在于許多其它淋巴細(xì)胞、非淋巴細(xì)胞、病毒基因增強(qiáng)子和啟動(dòng)子以及HIV-1的長未端重復(fù)序列中,如某些MHCⅠ類基因,IL-2Rα鏈,TCRβ鏈,IL-2、IL-3、IL-6、IFN-α、IFN-β、IFN調(diào)節(jié)因子、GM-CSF、SV40基因等。在不轉(zhuǎn)錄κ基因的前B細(xì)胞(pre-b cell)系中無NF-κB活性,這些細(xì)胞用LPS處理后可誘導(dǎo)出有功能的NF-κB,隨之也刺激κ鏈基因的轉(zhuǎn)錄。
(2)NF-κB結(jié)構(gòu)及作用特點(diǎn):NF-κB是一個(gè)異源四聚體復(fù)合物,包含兩個(gè)與DNA結(jié)合的50kDa多肽和兩個(gè)不與DNA直接結(jié)合的65kDa多肽鏈NF-κB解離常數(shù)在10-12~10-13M之間,這種高親和力是它發(fā)揮功能所必需的。在大多數(shù)細(xì)胞系中由于抑制因子IκB與p65的偶聯(lián)作用,使整個(gè)NF-κB分子以無活性的形式存在于細(xì)胞質(zhì)內(nèi)。IκB由于磷酸化(如PKC作用)或其它的修飾作用喪失功能,從NF-κB/IκB復(fù)合物上解離下來,洲離的NF-κB隨即進(jìn)入細(xì)胞核,結(jié)合靶基因的特定序列,從而激活這一基因的轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。如抗原結(jié)合到B細(xì)胞mIg后刺激B細(xì)胞內(nèi)PKC活化。LPS也可活化PKC。NF-κB在有效合成κ鏈的骨髓瘤細(xì)胞中是無活性或是缺乏的,提示NF-κB和κ鏈基因的增強(qiáng)子在B細(xì)胞分化早期對(duì)于起始κ基因轉(zhuǎn)錄是需要的,但對(duì)于分化后期維持轉(zhuǎn)錄過程中并不是必需的。
圖3-12 免疫球蛋白基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)節(jié)
注:VDJ重排使啟動(dòng)子(P)靠近位于Jκ和Cκ之間的增強(qiáng)子,增加了已重排V2基因的轉(zhuǎn)錄水平,DNA結(jié)合蛋白NF-κB結(jié)合到增強(qiáng)子內(nèi)靶序列,Oct1、Oct2可結(jié)合到啟動(dòng)子上。
(二)等位基因排斥現(xiàn)象
免疫球蛋白基因表達(dá)中一個(gè)重要的發(fā)現(xiàn)是等位基因排斥現(xiàn)象(allelic exclusion)。編碼人Ig重鏈基因位于第14對(duì)染色體上,在B細(xì)胞發(fā)育過程中,這一對(duì)同源染色體中僅有一條染色體Ig基因得到表達(dá)。例如一個(gè)人B細(xì)胞內(nèi)來自母本的染色體上的Ig重鏈基因得到表達(dá),則來自父本的第14號(hào)染色體的Ig重鏈基因受到抑制而不表達(dá)。這可能是通過已發(fā)生有效重排的染色體產(chǎn)生反饋抑制(feedbackinhibition)信號(hào)抑制另一條同源染色體上的Ig重鏈基因發(fā)生重排。一條染色體上Ig重鏈基因的有效重排,一方面抑制了另一條同源染色體重鏈基因的重排,另一方面可發(fā)出信號(hào)使第2號(hào)染色體上Igκ輕鏈基因發(fā)生重排,如果一對(duì)同源染色體上的κ輕鏈基因重排均無效,才發(fā)生22號(hào)染色體λ輕鏈基因重排,這種現(xiàn)象稱為輕鏈同種型排斥現(xiàn)象(light chain isotype exclusion)。
機(jī)體對(duì)外界環(huán)境中眾多抗原刺激可產(chǎn)生相應(yīng)的特異性抗體,有人推算抗體的多樣性在107以上,這種抗體多樣性主要是由遺傳控制的。引起免疫球蛋白多樣性的原因主要有以下幾個(gè)方面。
1.胚系中眾多的V、D、J基因片段 胚系(germ line)中未重排的(unrearranged) DNA有眾多的V基因片段以及一定數(shù)量的D、J基因片段。以小鼠為例。VH、DH和JH基因片段分別為1000、12和4,單獨(dú)重鏈重組的多樣性可達(dá)4.8×104左右;Vκ和Jκ分別約為250和4,κ輕鏈V-J重排的多樣性為1.0×103。經(jīng)重鏈與κ輕鏈隨機(jī)配對(duì)后推算的多樣性為(4.8×104)×(1.0×103)=4.8×107。
表3-5 小鼠Ig胚系基因片段和重鏈、κ輕鏈配對(duì)的多樣性
多肽鏈 | 基因片段數(shù) | 可變區(qū)基因 | 經(jīng)重排和隨機(jī)配對(duì)后 | |
V J | 重組方式 | 推算的多樣性數(shù)目 | ||
重 鏈 | 1000 12 4 | V-D-J | 4.8×104 | |
4.8×107 | ||||
κ輕鏈 | 250 | V-J | 1.0×103 |
注:多樣性數(shù)目不包括VDJ連接多樣性、N區(qū)插入和體細(xì)胞突變所增加的多樣性數(shù)目。
2.VDJ連接的多樣性 輕鏈基因重排過程中,VJ連接點(diǎn)以及重鏈基因重排過程中D-J以及V-D-J連接點(diǎn)有一定的變異范圍。例如輕鏈VL因片段3′端5個(gè)核苷酸CCTCC和JL基因片段5′端4個(gè)核苷酸GTGG連接時(shí),9個(gè)核苷酸中只有6個(gè)核苷酸編碼輕鏈第95、96位氨基酸,可產(chǎn)生8種不同的連接方式(圖3-13)。
3.體細(xì)胞突變(somatic mutation) 體細(xì)胞在發(fā)育過程中可發(fā)生基因的突變。以長期體外培養(yǎng)的B細(xì)胞前體為例,每個(gè)細(xì)胞每個(gè)堿基對(duì)的突變率為1~3×10-5,這種類型突變主要發(fā)生在V基因。體細(xì)胞突變擴(kuò)展了原有胚系眾多基因片段的多樣性。
4.N區(qū)的插入(insert of N region) 在Ig重鏈基因片段重排過程中,有時(shí)可通過無模板指導(dǎo)的機(jī)理(non-temple directed mechanism)在重組后D基因片段的兩側(cè)即VH-DH或DH-JH連接處插入稱之為N區(qū)的幾個(gè)核苷酸。N區(qū)不是由胚系基因所編碼。在N區(qū)插入前,先通過外切酶切除VH-DH或DH-JH連接處的兒個(gè)堿基對(duì),然后通過末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶(terminal deoxynucleotidyl transferase,TdT)連接上N區(qū)。由于額外插入了N區(qū),可發(fā)生移碼突變(frameshift mutation),使插入部位以及下游密碼子發(fā)生改變,從而編碼不同的氨基酸,增加了抗體的多樣性。
圖3-13 輕鏈基因V-J連接多樣性舉例
圖3-14 N區(qū)插入D-J連的接處(示意圖)
5.輕鏈重鏈相互隨機(jī)配對(duì) 如表3-5所示,小鼠重鏈與κ輕鏈隨機(jī)配對(duì)后推算的多樣性可達(dá)4.8×107,如果再加上重鏈與λ輕鏈的隨機(jī)配對(duì)其多樣性就更多了。