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發(fā)現(xiàn)新基因的方法和使用的計(jì)算機(jī)系統(tǒng)平臺(tái)以及新基因

公開(kāi)(公告)號(hào) CN1884521A  
公開(kāi)(公告)日 2006.12.27  
申請(qǐng)(專(zhuān)利)號(hào) CN200610089339.9  
申請(qǐng)日期 2006.06.21  
專(zhuān)利名稱(chēng) 發(fā)現(xiàn)新基因的方法和使用的計(jì)算機(jī)系統(tǒng)平臺(tái)以及新基因  
主分類(lèi)號(hào) C12N15/09(2006.01)I  
分類(lèi)號(hào) C12N15/09(2006.01)I;G06F19/00(2006.01)I;C12N15/12(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I;A61K48/00(2006.01)I;A61P9/00(2006.01)I;C07K14/435(2006.01)I;A61K38/17(2006.01)I;G01N33/68(2006.01)I  
分案原申請(qǐng)?zhí)?  
優(yōu)先權(quán)  
申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人 北京未名福源基因藥物研究中心有限公司;天津溥瀛生物技術(shù)有限公司;美國(guó)福源集團(tuán)  
發(fā)明(設(shè)計(jì))人 于在林;鄭志華;唐元華;富 巖  
地址 100085北京市海淀區(qū)上地39號(hào)北大生物城  
頒證日  
國(guó)際申請(qǐng)  
進(jìn)入國(guó)家日期  
專(zhuān)利代理機(jī)構(gòu) 北京三友知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司  
代理人 丁香蘭;趙曉梅  
國(guó)省代碼 北京;11  
主權(quán)項(xiàng) 一種發(fā)現(xiàn)新基因的方法,該方法包括以下步驟: 1)從已公開(kāi)發(fā)表的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取長(zhǎng)度小于300AA或400AA或500AA,首選的是300AA、優(yōu)選的是400AA、更優(yōu)選的是500AA的所有蛋白質(zhì)序列,并將這些序列轉(zhuǎn)為統(tǒng)一格式; 2)對(duì)上述蛋白質(zhì)序列進(jìn)行批量跨膜區(qū)域分析從中排除含有跨膜區(qū)域的所有序列; 3)對(duì)保留的序列批量進(jìn)行分泌型信號(hào)肽分析; 4)將獲取的序列片段作為模型對(duì)表達(dá)序列標(biāo)簽文庫(kù)作比對(duì),獲得具有一定匹配的表達(dá)序列標(biāo)簽; 5)對(duì)表達(dá)序列標(biāo)簽進(jìn)行拼接;和 6)與已知數(shù)據(jù)庫(kù)的序列進(jìn)行比較,獲得新的全長(zhǎng)基因。  
摘要 本發(fā)明涉及一個(gè)利用生物信息學(xué)分析,計(jì)算機(jī)模擬預(yù)測(cè)技術(shù)和分子生物學(xué)技術(shù)來(lái)發(fā)現(xiàn)新基因的計(jì)算機(jī)分析系統(tǒng)平臺(tái)。特別是本發(fā)明利用已知的人類(lèi)基因組序列資料,通過(guò)自編程序和分析途經(jīng),獲得了一種便捷和有效的計(jì)算機(jī)分析和預(yù)測(cè)手段,發(fā)現(xiàn)和制備了一系列的具有生物學(xué)功能的新基因。本發(fā)明同時(shí)還公開(kāi)了兩個(gè)新發(fā)現(xiàn)的類(lèi)似于人載脂蛋白A1BP的基因,命名為:BFC06016和BFC06104,它們?cè)贕enBank的登錄號(hào)分別為:DQ778079和DQ778080。這兩個(gè)基因及所編碼的蛋白質(zhì)可能與膽固醇在體內(nèi)代謝相關(guān),可作為人類(lèi)心血管疾病診斷與治療的候選藥靶基因或作為基因藥物而具有臨床應(yīng)用意義。  
國(guó)際公布  
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