基因組是生物的生殖細(xì)胞中所含全部基因的總和。人類(lèi)基因組具有極其復(fù)雜的結(jié)構(gòu),其編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因大約有100 000個(gè),每個(gè)單倍體DNA含有3.2×109 bp,分布在24條常染色體和X,Y性染色體上。此外,還含有大量的非編碼的重復(fù)DNA序列;蚨ㄎ唬╣ene location)是用一定的方法將基因確定到染色體的實(shí)際位置。這是現(xiàn)代遺傳學(xué)的重要研究?jī)?nèi)容之一。將不同的基因確定于染色體的具體位置之后,即可繪制出基因圖(gene map)。
有兩種基本方式制作人類(lèi)染色體的基因圖:即物理作圖和遺傳作圖。物理作圖(physical mapping)是從DNA分子水平制作基因圖。它表示不同基因(包括遺傳標(biāo)記)在染色體上的實(shí)際距離,是以堿基對(duì)為衡量標(biāo)準(zhǔn),所以物理圖譜(physical map)最終是以精確的DNA堿基對(duì)順序來(lái)表達(dá),從而說(shuō)明基因的DNA分子結(jié)構(gòu)。從細(xì)胞遺傳學(xué)水平,用染色體顯帶等技術(shù)在光學(xué)顯微鏡下觀察,將基因定位不同染色體的具體區(qū)帶,又稱(chēng)區(qū)域定位(regiona assignmer),而把基因只定位到某條染色體上稱(chēng)為染色體定位(chromosomal assignment)。這個(gè)水平上的基因圖譜又稱(chēng)細(xì)胞遺傳圖(cytogenetical map)。分辨率可達(dá)5Mb至1Mb。遺傳作圖(genetic mapping)是以研究家族的減數(shù)分裂,以了解兩個(gè)基因分離趨勢(shì)為基礎(chǔ)來(lái)繪制基因座位間的距離,它表明基因之間連鎖關(guān)系和相對(duì)距離,并以重組率來(lái)計(jì)算和表示,以厘摩(cM)為單位。兩個(gè)遺傳座位間1%的重組率即為1厘摩。人類(lèi)精細(xì)的遺傳圖水平可達(dá)1cM即100kb(1Mb)左右。
根據(jù)系譜分析和少數(shù)血型分析,就可確定某些基因位于X染色體上。X連鎖關(guān)系確定后,再依重組率計(jì)算兩者之間的相對(duì)距離,便可將兩個(gè)基因定位于XX染體的相對(duì)位置上,1961年紅綠色盲就是通過(guò)這種方法定位于X染色體上。
1968年Donahue依據(jù)系譜分析的原理,第一次將Duffy血型基因定位于第1號(hào)常染色體上。它在中期染色體時(shí),發(fā)現(xiàn)1號(hào)染色體長(zhǎng)臂1區(qū)的異染色質(zhì)區(qū)有變異特征。繼后,他發(fā)現(xiàn)在一些家族中,凡是具有這種形態(tài)特征的染色體都是Duffy血型者,從而將此血型的基因定位于第1號(hào)染色體上。伴隨分子生物學(xué)和細(xì)胞分子遺傳學(xué)的進(jìn)展,基因定位的新方法不斷出現(xiàn),特別是體細(xì)胞雜交、分子雜交、DNA重組和DNA體外擴(kuò)增(PCR)等技術(shù)后出現(xiàn)與應(yīng)用,產(chǎn)生了許多定位新技術(shù),如脈沖場(chǎng)凝膠電泳、染色體顯微攝影、染色體步移和酵母人工染色體(YAC)克隆等,使基因定位的研究工作得到迅速發(fā)展。醫(yī)學(xué)全在線www.med126.com
自1973年第一次國(guó)際人類(lèi)基因組制圖(human genome mapping,HGM)會(huì)議召開(kāi)以來(lái),每隔2-3年就舉行一次會(huì)議。在第一次HGM會(huì)議上,人類(lèi)基因定位只有31個(gè),而今迅速進(jìn)展到已定位的基因4000多個(gè),而且有一大批克隆基因和DNA遺傳標(biāo)記被定位,如表7-1所示。這些成果有力地推動(dòng)了遺傳咨詢、基因診斷和基因治療的進(jìn)展,對(duì)醫(yī)學(xué)理論和臨床實(shí)踐的發(fā)展起著十分重要的作用。
表7-1 HGM會(huì)議定位的克隆基因和DNA多態(tài)標(biāo)記
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HGM11(1999年) |
CCM(1992年) |
HGM12/CCM93(1993年) |
基因總數(shù) 克隆基因 多態(tài)標(biāo)記 |
2778 1524 622 |
3301 713 |
4183 3808 850 |
DNA節(jié)段總數(shù) 多態(tài)標(biāo)記 克隆DNA |
6974 2608 9760 |
12376 3250 16277 |
25640 5114 29833 |
多態(tài)標(biāo)記總數(shù) 微衛(wèi)星 |
3230 312 |
3963 812 |
5964 2427 |