氨基酸（amino acids）:
是含有一個(gè)堿性氨基和一個(gè)酸性羧基的有機(jī)化合物，氨基一般連接在α-碳上。氨基酸是肽和蛋白質(zhì)的構(gòu)件分子。
必需氨基酸（essential amino acids）：
指人（或其它脊椎動(dòng)物）自己不能合成，需要從飲食中獲得的氨基酸，例如賴氨酸、蘇氨酸等氨基酸。
非必需氨基酸（nonessential amino acids）：　
指人（或其它脊椎動(dòng)物）自己能由簡(jiǎn)單的前體合成的，不需要由飲食供給的氨基酸，例如甘氨酸、丙氨酸等氨基酸。
等電點(diǎn)（pI，isoelectric point）：
使分子處于兼性分子狀態(tài)，在電場(chǎng)中不遷移（分子的凈電荷為零）的pH值。     茚三酮反應(yīng)（ninhydrin reaction）：
在加熱條件下，氨基酸或肽與茚三酮反應(yīng)生成紫色（與脯氨酸反應(yīng)生成黃色）化合物的反應(yīng)。
肽鍵（peptide bond）：
一個(gè)氨基酸的羧基與另一個(gè)氨基酸的氨基縮合，除去一分子水形成的酰胺鍵。
肽（peptides）：兩個(gè)或兩個(gè)以上氨基酸通過肽鍵共價(jià)連接形成的聚合物。
蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)(primary structure)：指蛋白質(zhì)中共價(jià)連接的氨基酸殘基的排列順序。
層析(chromatography)：
按照在移動(dòng)相（可以是氣體或液體）和固定相（可以是液體或固體）之間的分配比例將混合成分分開的技術(shù)。
離子交換層析(ion-exchange column chromatography)：
使用帶有固定的帶電基團(tuán)的聚合樹脂或凝膠層析柱分離離子化合物的層析方法。
透析（dialysis）：
通過小分子經(jīng)半透膜擴(kuò)散到水（或緩沖液）的原理將小分子與生物大分子分開的一種分離純化技術(shù)。
凝膠過濾層析(gel filtration chromatography)：
也叫做分子排阻層析（molecular-exclusion chromatography）。一種利用帶孔凝膠珠作基質(zhì)，按照分子大小分離蛋白質(zhì)或其它分子混合物的層析技術(shù)。
親和層析（affinity chromatography）：
利用共價(jià)連接有特異配體的層析介質(zhì)分離蛋白質(zhì)混合物中能特異結(jié)合配體的目的蛋白或其它分子的層析技術(shù)。
高壓液相層析（HPLC，high-pressure liquid chromatography）：
使用顆粒極細(xì)的介質(zhì)，在高壓下分離蛋白質(zhì)或其它分子混合物的層析技術(shù)。
凝膠電泳（gel electrophoresis）：
以凝膠為介質(zhì)，在電場(chǎng)作用下分離蛋白質(zhì)或核酸等分子的分離純化技術(shù)。
SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳：（SDS-PAGE，sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrohoresis）
在有去污劑十二烷基硫酸鈉存在下的聚丙烯酰胺凝膠電泳。SDS-PAGE只是按照分子大小分離的，而不是根據(jù)分子所帶的電荷和大小分離的。
等電聚焦電泳（IFE，isoelectric focusing electrophoresis）：
利用特殊的一種緩沖液（兩性電解質(zhì)）在聚丙烯酰胺凝膠內(nèi)制造一個(gè)pH梯度，電泳時(shí)每種蛋白質(zhì)就將遷移到它的等電點(diǎn)（pI）處，即梯度中的某一pH時(shí)，就不再帶有凈的正或負(fù)電荷了。
雙向電泳（two-dimensional electrophoresis）：
是等電聚焦電泳和SDS-PAGE的組合，即先進(jìn)行等電聚焦電泳（按照pI分離），然后再進(jìn)行SDS-PAGE（按照分子大�。�，經(jīng)染色得到的電泳圖是個(gè)二維分布的蛋白質(zhì)圖。
Edman降解(Edman degradation)：
從多肽鏈游離的N末端測(cè)定氨基酸殘基的序列的過程。N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯修飾，然后從多肽鏈上切下修飾的殘基，再經(jīng)層析鑒定，余下的多肽鏈（少了一個(gè)殘基）被回收再進(jìn)行下一輪降解循環(huán)。
同源蛋白質(zhì)（homologous proteins）:
來自不同種類生物、而序列和功能類似的蛋白質(zhì)。例如血紅蛋白。
構(gòu)型（configuration）：
一個(gè)有機(jī)分子中各個(gè)原子特有的固定的空間排列。這種排列不經(jīng)過共價(jià)鍵的斷裂和重新形成是不會(huì)改變的。構(gòu)型的改變往往使分子的光學(xué)活性發(fā)生變化。
構(gòu)象（conformation）：
指一個(gè)分子中，不改變共價(jià)鍵結(jié)構(gòu)，僅單鍵周圍的原子旋轉(zhuǎn)所產(chǎn)生的原子的空間排布。一種構(gòu)象改變?yōu)榱硪环N構(gòu)象時(shí)，不要求共價(jià)鍵的斷裂和重新形成。構(gòu)象改變不會(huì)改變分子的光學(xué)活性。
肽單位（peptide unit）：
又稱之肽基（peptide group），是肽鏈主鏈上的重復(fù)結(jié)構(gòu)。是由參與肽鍵形成的氮原子和碳原子和它們的4個(gè)取代成分：羰基氧原子、酰胺氫原子和兩個(gè)相鄰的α-碳原子組成的一個(gè)平面單位。
蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)（protein secondary structure）:
在蛋白質(zhì)分子中的局部區(qū)域內(nèi)氨基酸殘基的有規(guī)則的排列，常見的二級(jí)結(jié)構(gòu)有α-螺旋和β-折疊。二級(jí)結(jié)構(gòu)是通過骨架上的羰基和酰胺基團(tuán)之間形成的氫鍵維持的。
蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)（protein tertiary structure）:
蛋白質(zhì)分子處于它的天然折疊狀態(tài)的三維構(gòu)象。三級(jí)結(jié)構(gòu)是在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進(jìn)一步盤繞、折疊形成的。三級(jí)結(jié)構(gòu)主要是靠氨基酸側(cè)鏈之間的疏水相互作用、氫鍵范德華力和鹽鍵（靜電作用力）維持的。蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)（quaternary structure）:
多亞基蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)。實(shí)際上是具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈（亞基）以適當(dāng)方式聚合所呈現(xiàn)出的三維結(jié)構(gòu)。
α-螺旋(α-helix)：
蛋白質(zhì)中常見的一種二級(jí)結(jié)構(gòu)，肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀，一般都是右手螺旋結(jié)構(gòu)，螺旋是靠鏈內(nèi)氫鍵維持的。每個(gè)氨基酸殘基（第n個(gè)）的羰基氧與多肽鏈C端方向的第4個(gè)殘基（第n＋4個(gè)）的酰胺氮形成氫鍵。在典型的右手α-螺旋結(jié)構(gòu)中，螺距為0.54nm，每一圈含有3.6個(gè)氨基酸殘基，每個(gè)殘基沿著螺旋的長(zhǎng)軸上升0.15nm。
β-折疊(β-sheet)：
是蛋白質(zhì)中的常見的二級(jí)結(jié)構(gòu)，是由伸展的多肽鏈組成的。折疊片的構(gòu)象是通過一個(gè)肽鍵的羰基氧和位于同一個(gè)肽鏈或相鄰肽鏈的另一個(gè)酰胺氫之間形成的氫鍵維持的。氫鍵幾乎都垂直伸展的肽鏈，這些肽鏈可以是平行排列（走向都是由N到C方向）；或者是反平行排列（肽鏈反向排列）。
β-轉(zhuǎn)角（β-turn）:
也是多肽鏈中常見的二級(jí)結(jié)構(gòu)，連接蛋白質(zhì)分子中的二級(jí)結(jié)構(gòu)（α-螺旋和β-折疊），使肽鏈走向改變的一種非重復(fù)多肽區(qū)，一般含有2～16個(gè)氨基酸殘基。含有5個(gè)氨基酸殘基以上的轉(zhuǎn)角又常稱之環(huán)（loops）。常見的轉(zhuǎn)角含有4個(gè)氨基酸殘基，有兩種類型。轉(zhuǎn)角I的特點(diǎn)是：第1個(gè)氨基酸殘基羰基氧與第4個(gè)殘基的酰胺氮之間形成氫鍵；轉(zhuǎn)角II的第3個(gè)殘基往往是甘氨酸。這兩種轉(zhuǎn)角中的第2個(gè)殘基大都是脯氨酸。
超二級(jí)結(jié)構(gòu)（super-secondary structure）：
也稱之基元（motif）。在蛋白質(zhì)中，特別是球蛋白中，經(jīng)�？梢钥吹接扇舾上噜彽亩�級(jí)結(jié)構(gòu)單元組合在一起，彼此相互作用，形成的有規(guī)則、在空間上能辨認(rèn)的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合體。
結(jié)構(gòu)域(domain)：
在蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)內(nèi)的獨(dú)立折疊單元。結(jié)構(gòu)域通常都是幾個(gè)超二級(jí)結(jié)構(gòu)單元的組合。
纖維蛋白(fibrous proteins)：
一類主要的不溶于水的蛋白質(zhì)，通常都含有呈現(xiàn)相同二級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈。許多纖維蛋白結(jié)合緊密，并為單個(gè)細(xì)胞或整個(gè)生物體提供機(jī)械強(qiáng)度，起著保護(hù)或結(jié)構(gòu)上的作用。
球蛋白(globular proteins)：
一類蛋白質(zhì)，許多都溶于水，球蛋白是緊湊的、近似球形的、含有折疊緊密的多肽鏈。典型的球蛋白含有能特異識(shí)別和結(jié)合其它化合物的凹陷或裂隙部位。
角蛋白（keratins）：
由處于α-螺旋或β-折疊構(gòu)象的平行的多肽鏈組成的不溶于水的起著保護(hù)或結(jié)構(gòu)作用的蛋白質(zhì)。
膠原（蛋白）（collagen）：
是動(dòng)物結(jié)締組織中最豐富的一種結(jié)構(gòu)蛋白，它是由原膠原蛋白分子組成，原膠原蛋白是一種具有右手超螺旋結(jié)構(gòu)的蛋白。每個(gè)原膠原分子都是由3條特殊的左手螺旋（螺距0.95nm，每一圈含有3.3個(gè)殘基）的多肽鏈右手旋轉(zhuǎn)形成的。
疏水相互作用(hydrophobic interaction)：
非極性分子之間的一種弱的、非共價(jià)的相互作用。這些非極性分子（如一些中性氨基酸殘基，也稱之疏水殘基）在水相環(huán)境中具有避開水而相互聚集的傾向。
伴娘蛋白（chaperone）：
與一種新合成的多肽鏈形成復(fù)合物并協(xié)助它正確折疊成具有生物功能構(gòu)象的蛋白質(zhì)。伴娘蛋白可以防止不正確折疊中間體的形成和沒有組裝的蛋白亞基的不正確的聚集，協(xié)助多肽鏈跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)以及大的多亞基蛋白質(zhì)的組裝和解體。
二硫鍵（disulfide bond）：
通過兩個(gè)（半胱氨酸）巰基的氧化形成的共價(jià)鍵。二硫鍵在穩(wěn)定某些蛋白的三維結(jié)構(gòu)上起著重要的作用。
范德華力（van der Waals force）：
中性原子之間通過瞬間靜電相互作用產(chǎn)生的一種弱的分子之間的力。當(dāng)兩個(gè)原子之間的距離為它們的范德華半徑之和時(shí)，范德華引力最強(qiáng)。強(qiáng)的范德華排斥作用可以防止原子相互靠近。
蛋白質(zhì)變性（denaturation）：
生物大分子的天然構(gòu)象遭到破壞導(dǎo)致其生物活性喪失的現(xiàn)象。蛋白質(zhì)在受到光照、熱、有機(jī)溶劑以及一些變性劑的作用時(shí)，次級(jí)鍵受到破壞，導(dǎo)致天然構(gòu)象的破壞，使蛋白質(zhì)的生物活性喪失。
復(fù)性（renaturation）：
在一定的條件下，變性的生物大分子恢復(fù)成具有生物活性的天然構(gòu)象的現(xiàn)象。
肌紅蛋白（myoglobin）：
是由一條肽鏈和一個(gè)血紅素輔基組成的結(jié)合蛋白，是肌肉內(nèi)儲(chǔ)存氧的蛋白質(zhì)，它的氧飽和曲線為雙曲線型。
血紅蛋白（hemoglobin）：
是由含有血紅素輔基的4個(gè)亞基組成的寡聚蛋白。血紅蛋白負(fù)責(zé)將氧由肺運(yùn)輸?shù)酵庵芙M織，它的氧飽和曲線為S型。
波爾效應(yīng)（Bohr effect）：
CO2濃度的增加降低細(xì)胞內(nèi)的pH，引起紅細(xì)胞內(nèi)血紅蛋白的氧親和力下降的現(xiàn)象。
別構(gòu)效應(yīng)（allosteric effect）：
又稱之變構(gòu)效應(yīng)。是寡聚蛋白與配基結(jié)合改變蛋白質(zhì)的構(gòu)象，導(dǎo)致蛋白質(zhì)生物活性改變的現(xiàn)象。
鐮刀型細(xì)胞貧血病（sickle-cell anemia）：血紅蛋白分子遺傳缺陷造成的一種疾病，病人的大部分紅細(xì)胞呈鐮刀狀。其特點(diǎn)是病人的血紅蛋白β-亞基N端的第6個(gè)氨基酸殘基是纈氨酸，而不是正常的谷氨酸殘基。
酶（enzyme）:
生物催化劑，除少數(shù)RNA外幾乎都是蛋白質(zhì)。酶不改變反應(yīng)的平衡，只是通過降低活化能加快反應(yīng)的速度。
全酶（holoenzyme）：
具有催化活性的酶，包括所有的必需的亞基、輔基和其它的輔助因子。
脫輔基酶蛋白（apoenzyme）：
酶中除去催化活性可能需要的有機(jī)或無機(jī)輔助因子或輔基后的蛋白質(zhì)部分。
酶活力單位（U，active unit）：
酶活力的度量單位。1961年國際酶學(xué)會(huì)議規(guī)定：1個(gè)酶活力單位是指在特定條件（25℃，其它為最適條件）下，在1分鐘內(nèi)能轉(zhuǎn)化1微摩爾底物的酶量，或是轉(zhuǎn)化底物中1微摩爾的有關(guān)基團(tuán)的酶量。
比活(specific activity)：
每分鐘每毫克酶蛋白在25℃下轉(zhuǎn)化的底物的微摩爾數(shù)（μm）。比活是酶純度的測(cè)量。
活化能（activation energy）：將一摩爾反應(yīng)底物中的所有分子由基態(tài)轉(zhuǎn)化為過渡態(tài)所需要的能量。
活性部位（active site）:
酶中含有底物結(jié)合部位和參與催化底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的氨基酸殘基的部分。活性部位通常都位于蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域或亞基之間的裂隙或是蛋白質(zhì)表面的凹陷部位，通常都是由在三維空間上靠得很近的一些氨基酸殘基組成的。
酸-堿催化（acid-base catalysis）：質(zhì)子轉(zhuǎn)移加速反應(yīng)的催化作用。共價(jià)催化（covalent catalysis）：
一個(gè)底物或底物的一部分與催化劑形成共價(jià)鍵，然后被轉(zhuǎn)移給第二個(gè)底物。許多酶催化的基團(tuán)轉(zhuǎn)移反應(yīng)都是通過共價(jià)催化方式進(jìn)行的。
靠近效應(yīng)（proximity effect）：
非酶促反應(yīng)或酶促反應(yīng)速率的增加是由于活性部位處反應(yīng)劑有效濃度增大（底物靠近活性部位）的結(jié)果，這將導(dǎo)致更頻繁地形成過渡態(tài)。
初速度(initial velocity)：
酶促反應(yīng)最初階段底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的速度，這一階段產(chǎn)物的濃度非常低，其逆反應(yīng)可以忽略不計(jì)。
米氏方程（Michaelis-Menten equation）:
表示一個(gè)酶促反應(yīng)的起始速度（v）與底物濃度（[S]）關(guān)系的速度方程，v＝Vmax[S]/（Km+[S]）。
米氏常數(shù)（Michaelis constant,）（Km）：
對(duì)于一個(gè)給定反應(yīng)，導(dǎo)致酶促反應(yīng)速度的起始速度（v0）達(dá)到最大反應(yīng)速度（Vmax）一半時(shí)的底物濃度。
催化常數(shù)（catalytic number）（Kcat）:
也稱之轉(zhuǎn)換數(shù)(turnover number)。一個(gè)動(dòng)力學(xué)常數(shù)，是在底物濃度處于飽和狀態(tài)下，一個(gè)酶（或一個(gè)酶活性部位）催化一個(gè)反應(yīng)有多快的測(cè)量。催化常數(shù)等于最大反應(yīng)速度除以總的酶濃度（Vmax/[E]total），或者是每摩爾酶活性部位每秒鐘轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的底物的摩爾數(shù)。
雙倒數(shù)作圖（double-reciprocal plot）:
也稱之Lineweaver-Burk作圖。一個(gè)酶促反應(yīng)速度的倒數(shù)（1/v）對(duì)底物濃度的倒數(shù)（1/[s]）的作圖。X和y軸上的截距分別代表米氏常數(shù)（Km）和最大反應(yīng)速度（Vmax）的倒數(shù)。
競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用（competitive inhibition）：
通過增加底物濃度可以逆轉(zhuǎn)的一種酶抑制類型。一個(gè)競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑通常與正常的底物或配體競(jìng)爭(zhēng)同一個(gè)蛋白質(zhì)的結(jié)合部位。這種抑制使得Km增大，而Vmax不變。
非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用（noncompetitive inhibition）：
抑制劑不僅與游離酶結(jié)合，也可以與酶-底物復(fù)合物結(jié)合的一種酶促反應(yīng)抑制作用。這種抑制使得Vmax變小，但Km不變。
反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用（uncompetitive inhibition）：
抑制劑只與酶-底物復(fù)合物結(jié)合，而不與游離酶結(jié)合的一種酶促反應(yīng)抑制作用。這種抑制作用使得Vmax，Km都變小，但Vmax/Km比值不變。
絲氨酸蛋白酶（serine protease）：活性部位含有在催化期間起著親核體作用的絲氨酸殘基的蛋白酶。
酶原（zymogen）：通過有限蛋白水解能夠由無活性變成具有催化活性的酶前體。
調(diào)節(jié)酶（regulatory enzyme）：位于一個(gè)或多個(gè)代謝途徑內(nèi)的一個(gè)關(guān)鍵部位的酶，它的活性根據(jù)代謝的需要被增加或降低。
別構(gòu)酶（allosteric enzyme）：一種其活性受到結(jié)合在活性部位以外部位的其它分子調(diào)節(jié)的酶。
別構(gòu)調(diào)節(jié)劑（allosteric modulator）:
結(jié)合在別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)部位調(diào)節(jié)該酶催化活性的生物分子，別構(gòu)調(diào)節(jié)劑可以是激活劑，也可以是抑制劑。
齊變模式（concerted model）：
相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的一種模式。按照最簡(jiǎn)單齊變模式，由于一個(gè)底物或別構(gòu)調(diào)節(jié)劑的結(jié)合，蛋白質(zhì)的構(gòu)象在T（對(duì)底物親和性低的構(gòu)象）和R（對(duì)底物親和性高的構(gòu)象）之間變換。這一模式提出所有蛋白質(zhì)的亞基都具有同樣的構(gòu)象，或是T，或是R構(gòu)象。
序變模式（sequential model）：
相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的另外一種模式。按照最簡(jiǎn)單的序變模式，一個(gè)配體的結(jié)合會(huì)誘導(dǎo)它結(jié)合的亞基的三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化，以及使相鄰亞基的構(gòu)象發(fā)生很大的變化。按照序變模式，只有一個(gè)亞基對(duì)配體具有高的親和性。
同功酶(isoenzyme或isozyme)：
催化同一化學(xué)反應(yīng)而化學(xué)組成不同的一組酶。它們彼此在氨基酸序列、底物的親和性等方面都存在著差異。
別構(gòu)調(diào)節(jié)物(allosteric modulator)：
也稱之別構(gòu)效應(yīng)物（allosteric effector）。結(jié)合在別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)部位，調(diào)節(jié)酶催化活性的生物分子。別構(gòu)調(diào)節(jié)物可以是激活劑或抑制劑
維生素(vitamin)：
是一類動(dòng)物本身不能合成但對(duì)動(dòng)物生長(zhǎng)和健康又是必需的有機(jī)化合物，所以必須從飲食中獲得。許多輔酶都是由維生素衍生的。
水溶性維生素（water-soluble vitamins）：
一類能溶于水的有機(jī)營養(yǎng)分子。其中包括在酶的催化中起著重要作用的B族維生素以及抗壞血酸（維生素C）等。
脂溶性維生素（lipid vitamins）：
由長(zhǎng)的碳?xì)滏溁虺憝h(huán)組成的聚戊二烯化合物。脂溶性維生素包括維生素A、D、E和K，這類維生素能被動(dòng)物貯存。
輔酶（coenzyme）：
某些酶在發(fā)揮催化作用時(shí)所需要的一類輔助因子，其成分中往往含有維生素。
輔基(prosthetic group)：
是與酶蛋白共價(jià)結(jié)合的金屬離子或一類有機(jī)化合物，用透析法不能除去。輔基在整個(gè)酶促反應(yīng)過程中始終與酶的特定部位結(jié)合。
尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸和尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸
（NADP＋，nicotinamide adenine dinucleotide phosphate）：
含有尼克酰胺的輔酶，在某些氧化還原反應(yīng)中起著氫原子和電子載體的作用，常常作為脫氫酶的輔酶。
黃素單核苷酸（FMN, flavin mononucleotide）：核黃素磷酸，是某些氧化還原酶的輔酶。
黃素腺嘌呤二核苷酸（FAD, flavin adenine dinucleotide）：
是某些氧化還原酶的輔酶，含有核黃素。
硫胺素焦磷酸（thiamine pyrophosphate）：是維生素B1的輔酶形式，參與轉(zhuǎn)醛基反應(yīng)。
磷酸吡哆醛（pyidoxal phosphate）：
是維生素B6（吡哆醇）的衍生物，是轉(zhuǎn)氨酶、脫羧酶和消旋酶的輔酶。
生物素（biotin）：參與脫羧反應(yīng)的一種酶的輔助因子。
輔酶A（coenzyme A）：一種含有泛酸的輔酶，在某些酶促反應(yīng)中作為�；�的載體。
類胡蘿卜素（carotenoids）:由異戊二烯組成的脂溶性光合色素。
轉(zhuǎn)氨酶（transaminases）：也稱之氨基轉(zhuǎn)移酶（aminotransferases），在該酶的催化下一個(gè)α-氨基酸的氨基轉(zhuǎn)可移給另一個(gè)α-酮酸。
醛糖（aldoses）：一類單糖，該單糖中氧化數(shù)最高的碳原子（指定為C-1）是個(gè)醛基。
酮糖（ketoses）：一類單糖，該單糖中氧化數(shù)最高的碳原子（指定為C-2）是個(gè)酮基。
異頭物（anomers）:僅在氧化數(shù)最高的碳原子（異頭碳）具有不同構(gòu)型的糖分子的兩種異構(gòu)體。
異頭碳（anomeric carbon）：一個(gè)環(huán)化單糖的氧化數(shù)最高的碳原子。異頭碳具有一個(gè)羰基的化學(xué)反應(yīng)性。
變旋（mutarotation）:一個(gè)吡喃糖、呋喃糖或糖苷伴隨著它們的α-和β-異構(gòu)形式的平衡而發(fā)生的比旋度變化。
單糖（monosaccharide）：由三個(gè)或更多碳原子組成的具有經(jīng)驗(yàn)公式（CH2O）n的簡(jiǎn)單糖。
糖苷(glycosides)：?jiǎn)翁前肟s醛羥基與另一個(gè)分子（例如醇、糖、嘌呤或嘧啶）的羥基、胺基或巰基縮合形成的含糖衍生物。
糖苷鍵(glycosidic bond)：一個(gè)糖半縮醛羥基與另一個(gè)分子（例如醇、糖、嘌呤或嘧啶）的羥基、胺基或巰基之間縮合形成的縮醛或縮酮鍵，常見的糖苷鍵有O-糖苷鍵和N-糖苷鍵。
寡糖（oligoccharide）：由2個(gè)～20個(gè)單糖殘基通過糖苷鍵連接形成的聚合物。
多糖（polysaccharide）：20個(gè)以上的單糖通過糖苷鍵連接形成的聚合物。多糖鏈可以是線性的或帶有分支的。
還原糖（reducing sugar）：羰基碳（異頭碳）沒有參與形成糖苷鍵，因此可被氧化充當(dāng)還原劑的糖。
淀粉（starch）：一類可作為植物中貯存多糖的葡萄糖殘基的同聚物。由兩種形式的淀粉：一種是直鏈淀粉，是沒有分支的只是通過α-（1→4）糖苷鍵連接的葡萄糖殘基聚合物。另一種是支鏈淀粉，是含有分支的α-（1→4）糖苷鍵連接的葡萄糖殘基聚合物，支鏈在分支點(diǎn)處通過α-（1→6）糖苷鍵與主鏈相連。
糖原（glycogen）：是含有分支的α-（1→4）糖苷鍵連接在一起的葡萄糖的同聚物，支鏈在分支點(diǎn)處通過α-（1→6）糖苷鍵與主鏈相連。
極限糊精（limit dexitrin）:是指支鏈淀粉中帶有支鏈的核心部分，該部分在支鏈淀粉經(jīng)淀粉酶水解作用、糖原磷酸化酶或淀粉磷酸化酶作用后仍然存在。糊精的進(jìn)一步降解需要α（1→6）糖苷鍵的水解。
肽聚糖（peptidoglycan）：N-乙酰葡萄糖胺和N-乙酰唾液酸交替連接的雜多糖與不同組成的肽交叉連接形成的大分子。肽聚糖是許多細(xì)菌細(xì)胞壁的主要成分。
糖蛋白（glycoprotein）：含有共價(jià)連接的葡萄糖殘基的蛋白質(zhì)。
蛋白聚糖（proteoglycans）：由雜多糖與一個(gè)多肽鏈組成的雜化的大分子，多糖是分子的主要成分。
脂肪酸（fatty acid）：是指一端含有一個(gè)羧基的長(zhǎng)的脂肪族碳?xì)滏�。脂肪酸是最�?jiǎn)單的一種脂，它是許多更復(fù)雜的脂（例如三脂酰甘油、甘油磷脂、鞘磷脂和蠟）的成分。
飽和脂肪酸（saturated fatty acid）：不含有-C＝C-雙鍵的脂肪酸。
不飽和脂肪酸（unsaturated fatty acid）：至少含有一個(gè)-C＝C-雙鍵的脂肪酸。
必需脂肪酸（ossential fatty acids）：維持哺乳動(dòng)物正常生長(zhǎng)所需的，而動(dòng)物又不能合成的脂肪酸，例如亞油酸和亞麻酸。
三脂酰甘油（triacylglycerol）：也稱之甘油三酯（triglyceride）。一種含有與甘油酯化的3個(gè)脂�；�的脂。脂肪和油是三脂酰甘油的混合物。
磷脂（phospholipid）：含有磷酸成分的脂。例如卵磷脂、腦磷脂等。
鞘脂（sphingolipids）：
一類含有鞘氨醇骨架的兩性脂，一端連接著一個(gè)長(zhǎng)鏈的脂肪酸，了一端為一個(gè)極性的醇。鞘脂包括鞘磷脂、腦磷脂以及神經(jīng)節(jié)苷脂，一般存在于植物和動(dòng)物膜內(nèi)，尤其是在中樞神經(jīng)系統(tǒng)的組織內(nèi)含量豐富。
鞘磷脂（sphingomyelin）：
一種由神經(jīng)酰胺的C-1羥基上連接了磷酸膽堿（或磷酸乙醇胺）構(gòu)成的鞘脂。鞘磷脂存在于大多數(shù)哺乳動(dòng)物細(xì)胞的質(zhì)膜內(nèi)，是髓鞘的主要成分。
卵磷脂（lecithin）：
就是磷脂酰膽堿（PC，phosphatidyl choline），是磷脂酸與膽堿形成的酯。
腦磷脂（cephalin）：
就是磷脂酰乙醇胺（PE，phosphatidyl ethanolamine）,是磷脂酸與乙醇胺形成的酯。
脂質(zhì)體（liposome）：是由包圍水相空間的磷脂雙層形成的囊泡（小泡）。
生物膜（bioligical membrane）:鑲嵌有蛋白質(zhì)的脂雙層，起著劃分和分隔細(xì)胞和細(xì)胞器的作用。生物膜也是許多與能量轉(zhuǎn)化和細(xì)胞內(nèi)通訊有關(guān)的重要部位。
內(nèi)在膜蛋白（integral membrane proteins）：插入脂雙層的疏水核和完全跨越脂雙層的膜蛋白。
外周膜蛋白（peripheral membrane proteins）：通過與膜脂的極性頭部或內(nèi)在膜蛋白的離子相互作用和形成氫鍵與膜的內(nèi)、外表面弱結(jié)合的膜蛋白。膜蛋白一旦從膜上釋放出來，通常都是水溶性的。
流體鑲嵌模型(fluid mosaic model)：
針對(duì)生物膜的結(jié)構(gòu)提出的一種模型。在這個(gè)模型中，生物膜被描述成鑲嵌有蛋白質(zhì)的流體脂雙層，脂雙層在結(jié)構(gòu)和功能上都表現(xiàn)出不對(duì)稱性。有的蛋白質(zhì)"鑲"在脂雙層表面，有的則部分或全部嵌入其內(nèi)部，有的則橫跨整個(gè)膜。另外脂和膜蛋白都可以進(jìn)行橫向擴(kuò)散。
通透系數(shù)（permeability coefficient）:是離子或小分子擴(kuò)散過脂雙層膜能力的一種量度。
通道蛋白（channel proteins）:
是一種帶有中央水相通道的內(nèi)在膜蛋白，它可以使大小合適的離子和分子從膜的任一方向穿過膜。
（膜）孔蛋白（pore proteins）:其含義與通道蛋白類似，只是該術(shù)語常用于細(xì)菌。
被動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)（passive transport）：
也稱之易化擴(kuò)散（facilitated diffusion）。是一種轉(zhuǎn)運(yùn)方式，通過該方式溶質(zhì)特異結(jié)合于一個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白，然后被轉(zhuǎn)運(yùn)過膜，但轉(zhuǎn)運(yùn)是沿著濃度梯度下降方向進(jìn)行，所以被動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)不需要能量支持。
主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)（active transport）:
一種轉(zhuǎn)運(yùn)方式，通過該方式溶質(zhì)特異結(jié)合于一個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白，然后被轉(zhuǎn)運(yùn)過膜，但與被動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)方式相反轉(zhuǎn)運(yùn)是逆著濃度梯度方向進(jìn)行的，所以主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)需要能量來驅(qū)動(dòng)。在原發(fā)主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)過程中，能源可以是光、ATP或電子傳遞。而第二級(jí)主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)是在離子濃度梯度驅(qū)動(dòng)下進(jìn)行的。
協(xié)同運(yùn)送(cotransport)：兩種不同溶質(zhì)跨膜的耦聯(lián)轉(zhuǎn)運(yùn)�？梢酝ㄟ^一個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白進(jìn)行同一方向（同向轉(zhuǎn)運(yùn)）或反方向（反向轉(zhuǎn)運(yùn)）轉(zhuǎn)運(yùn)。
胞吞（作用）（endocytosis）：物質(zhì)被質(zhì)膜吞入并以膜衍生出的脂囊泡形式（物質(zhì)在囊泡內(nèi)）并被帶入到細(xì)胞內(nèi)的過程。
胞吐（作用）（exocytosis）：確定要分泌的物質(zhì)被包裹在脂囊泡內(nèi)，該囊泡與質(zhì)膜融合，然后將物質(zhì)釋放到細(xì)胞外空間的過程。
核苷（nucleoside）:
是由嘌呤或嘧啶堿基通過共價(jià)鍵與戊糖連接組成的化合物。核糖與堿基一般都是由糖的異頭碳與嘧啶的N-1或嘌呤的N-9之間形成的β-N-糖苷鍵連接的。
核苷酸（nucleotide）：核苷的戊糖成分中的羥基磷酸化形成的化合物。
cAMP（cyclic AMP）:3ˊ,5ˊ-環(huán)腺苷酸，細(xì)胞內(nèi)的第二信使，由于某些激素或其它分子信號(hào)刺激激活腺苷酸環(huán)化酶催化ATP環(huán)化形成的。
磷酸二酯鍵（phosphodiester linkage）：
一種化學(xué)基團(tuán)，指一分子磷酸與兩個(gè)醇（羥基）酯化形成的兩個(gè)酯鍵。該酯鍵成了兩個(gè)醇之間的橋梁。例如一個(gè)核苷的3ˊ羥基與另一個(gè)核苷的5ˊ羥基與同一分子磷酸酯化，就形成了一個(gè)磷酸二酯鍵。
脫氧核糖核酸（DNA , deoxyribonucleic acid）:
含有特殊脫氧核糖核苷酸序列的聚脫氧核苷酸，脫氧核苷酸之間是通過3ˊ,5ˊ-磷酸二酯鍵連接的。DNA是遺傳信息的載體。
核糖核酸（RNA , ribonucleic acid）:
通過3ˊ,5ˊ-磷酸二酯鍵連接形成的特殊核糖核苷酸序列的聚核糖核苷酸。
核糖體核糖核酸（rRNA, ribosomal robonucleic acid）：作為核糖體組成成分的一類RNA，rRNA是細(xì)胞內(nèi)最豐富的RNA。
信使核糖核酸（mRNA, messenger ribonucleic acid）：一類用作蛋白質(zhì)合成模板的RNA。
轉(zhuǎn)移核糖核酸（tRNA, transfer ribonucleic acid）：
一類攜帶激活氨基酸，將它帶到蛋白質(zhì)合成部位并將氨基酸整合到生長(zhǎng)著的肽鏈上的RNA。tRNA含有能識(shí)別模板mRNA上互補(bǔ)密碼的反密碼。
轉(zhuǎn)化（作用）（transformation）:一個(gè)外源DNA通過某種途徑導(dǎo)入一個(gè)宿主菌，引起該細(xì)菌的遺傳特性改變的作用。
轉(zhuǎn)導(dǎo)（作用）（transduction）: 借助于病毒載體，遺傳信息從一個(gè)細(xì)胞轉(zhuǎn)移到另一個(gè)細(xì)胞。
堿基對(duì)（base pair）：通過堿基之間氫鍵配對(duì)的核酸鏈中的兩個(gè)核苷酸，例如A與T或U，以及G與C配對(duì)。
查格夫法則（Chargaff's rules）：所有DNA中腺嘌呤與胸腺嘧啶的摩爾含量相等，（A＝T），鳥嘌呤和胞嘧啶的摩爾含量相等（G＝C），即嘌呤的總含量與嘧啶的總含量相等（A＋G＝T＋C）。DNA的堿基組成具有種的特異性，但沒有組織和器官的特異性。另外生長(zhǎng)發(fā)育階段、營養(yǎng)狀態(tài)和環(huán)境的改變都不影響DNA的堿基組成。

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