哲學(xué)與科學(xué)，在概念上的區(qū)別是前者著重于完備性而后者力求確定性。愛因斯坦說：“西方科學(xué)的發(fā)展是以兩個偉大的成就為基礎(chǔ)的，那就是希臘哲學(xué)家發(fā)明的形式邏輯體系(在歐幾里得幾何學(xué)中)，以及發(fā)現(xiàn)通過系統(tǒng)的實驗有可能找出因果關(guān)系(在文藝復(fù)興時期)。在我看來，中國的賢哲沒有走上這兩步，那是用不著驚奇的”，說明西方傳統(tǒng)哲學(xué)轉(zhuǎn)而包含著向科學(xué)的追求。中醫(yī)學(xué)的文化背景和歷史條件，使它富于哲理，中國傳統(tǒng)的天人合一說融匯于中醫(yī)的基礎(chǔ)理論里，這種境界不是西方傳統(tǒng)哲學(xué)(主客二分的思想)的那種抽象的概念世界，而是對現(xiàn)實事物的各種關(guān)系的整體把握，所以中醫(yī)學(xué)始終貫穿著整體觀，但是遠(yuǎn)離著現(xiàn)代科學(xué)。西方醫(yī)學(xué)并未受西方傳統(tǒng)哲學(xué)的影響，而是從屬于科學(xué)的發(fā)展，致力于局部而微觀的求證。
中醫(yī)學(xué)作為一門學(xué)科，如果與時代的發(fā)展脫節(jié)，那么不論它的過去如何輝煌燦爛，也可能和陳列的古董一樣，記載歷史而已。現(xiàn)代醫(yī)學(xué)是沿著工業(yè)革命的軌跡而發(fā)展至今，是基于對生物體的結(jié)構(gòu)以及疾病演變的觀測手段不斷更新而迅速進步，從世界上第一次的工業(yè)技術(shù)革命，第二次的信息技術(shù)革命及第三次已經(jīng)來臨的基因技術(shù)革命，21世紀(jì)將是生命科學(xué)的世紀(jì)，已經(jīng)準(zhǔn)備在3年內(nèi)完成人類基因的30億核苷酸測序，并提供象元素周期表那樣的人類基因組的生物學(xué)周期表，可供破譯疾病中的變異基因，探尋有效的基因治療，當(dāng)然，基因治療有它的局限性，目前開展大規(guī)模的基因治療并不現(xiàn)實，而大量人類疾病不能歸結(jié)于單基因的變異，而是多基因病，象心、腦血管病，
糖尿病，肥胖，
骨質(zhì)疏松等是由多種功能基因的調(diào)控失常所致。由于基因的復(fù)雜性，估計現(xiàn)代科學(xué)要花1個世紀(jì)才能弄清功能基因的結(jié)構(gòu)與相關(guān)功能，在基因表達(dá)方面缺乏整體性調(diào)節(jié)手段。因此還需要在宏觀(整體觀)與微觀、最基本的和最復(fù)雜的兩個層面同時作出努力，中醫(yī)學(xué)有望在宏觀著眼這方面發(fā)揮其特色與優(yōu)勢。
中醫(yī)學(xué)與現(xiàn)代醫(yī)學(xué)是兩種不同的學(xué)科體系，有不同的思維方式，西醫(yī)學(xué)的研究是從局部出發(fā)針對結(jié)構(gòu)，采取單方面拮抗性治療，中醫(yī)學(xué)與之迥然不同，其研究是從整體著眼針對功能，采取多方面的調(diào)節(jié)性治療。若以現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的研究結(jié)構(gòu)的思維方式是難以發(fā)掘與闡明中醫(yī)學(xué)的特色與精華，而必須遵循中醫(yī)在自身發(fā)展中的軌跡，力求以精確的定量檢測手段，探尋與體現(xiàn)中醫(yī)理論與實踐的客觀規(guī)律和科學(xué)內(nèi)涵。
