復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院位于上海繁華的徐家匯東側(cè)，她有著悠久的歷史和優(yōu)良的學(xué)風(fēng)，享譽(yù)海內(nèi)外。隨著中國教育體制的改革，2000年4月原復(fù)旦大學(xué)（創(chuàng)建于1905年）與原上海醫(yī)科大學(xué)（創(chuàng)建于1927年）合并，復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院于2001年7月27日成立，由復(fù)旦大學(xué)副校長王衛(wèi)平教授兼任院長。
　　復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院成立以來大膽探索體制改革。為創(chuàng)辦綜合性大學(xué)的一流醫(yī)學(xué)院，促進(jìn)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和臨床醫(yī)學(xué)的結(jié)合，加快醫(yī)學(xué)學(xué)科建設(shè)，由醫(yī)學(xué)院的領(lǐng)導(dǎo)和各附屬醫(yī)院的院長組成上海醫(yī)學(xué)院院務(wù)委員會(huì)，是學(xué)院的咨詢決策機(jī)構(gòu)。在教學(xué)管理架構(gòu)上設(shè)有27個(gè)系。在行政管理架構(gòu)上設(shè)有黨委辦公室、院長辦公室、教學(xué)辦公室、科研辦公室和本科生、研究生工作組，負(fù)責(zé)管理和協(xié)調(diào)學(xué)院各方面的工作。學(xué)院現(xiàn)有國家重點(diǎn)學(xué)科20個(gè)；國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)；“211工程”建設(shè)重點(diǎn)學(xué)科8個(gè)；教育部、衛(wèi)生部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室9個(gè)；上海市重點(diǎn)學(xué)科2個(gè)；上海市臨床醫(yī)學(xué)中心8個(gè)。有博士后流動(dòng)站4個(gè)，博士點(diǎn)29個(gè)，碩士點(diǎn)36個(gè)。