歷史溯源
復旦大學上海醫(yī)學院生物醫(yī)學研究院始建于2005年5月，是國家985工程建設的科技創(chuàng)新平臺和上海醫(yī)學院的研究機構(gòu)。研究院以“轉(zhuǎn)化醫(yī)學”為目標，積極推動復旦大學生命科學與醫(yī)學的有機結(jié)合，建立基礎科學與臨床需求的緊密聯(lián)系。
組織結(jié)構(gòu)、學科布局
生物醫(yī)學研究院實行首席科學家負責制和PI管理模式。研究院配置了國際先進的科研設備，創(chuàng)建了獨特的共享體制。機制上采用靈活的方式與各院系和附屬醫(yī)院進行共建。
生物醫(yī)學研究院建設有三個中心，一個平臺，即表觀遺傳醫(yī)學研究中心、系統(tǒng)生物醫(yī)學研究中心、分子細胞生物學研究中心和生物醫(yī)學公共技術(shù)平臺zxtf.net.cn。根據(jù)研究工作的需要，建設了蛋白質(zhì)組學與系統(tǒng)生物學、基因組學、、分子與細胞生物學、藥物與結(jié)構(gòu)生物學、傳染病與公共衛(wèi)生研究、病理研究、癌癥研究、心血管研究、干細胞研究、出生缺陷研究、小動物分子影像研究等十二個技術(shù)平臺，總建設實驗室面積4011平方米。
生物醫(yī)學研究院共有40萬元以上大型儀器設備51臺，10-40萬元的儀器131臺/套，包括大型質(zhì)譜儀、一代二代測序儀、核磁共振儀、X射線衍射儀、顯微切割儀、流式細胞儀、小動物SPECT/CT、小動物活體成像儀、小動物超聲、多功能工作站、多功能掃描儀、DNA合成儀等。通過開放共享的機制，研究院將為校內(nèi)外生物醫(yī)學研究工作者提供高水平的技術(shù)支持和服務。
師資力量
研究院現(xiàn)擁有院士13名，全時引進PI 19人，分時引進PI 7人，雙聘PI 50人，研究人員20余名，工程技術(shù)人員20余名�？蒲袌F隊中，短期項目千人計劃1人，長期項目千人計劃3人，青年千人計劃1人，長江學者特聘教授14人，長江學者講座教授6人，目前已形成的研究團隊包括：分子細胞生物學團隊、肝癌研究團隊、傳染病研究團隊、表觀遺傳學研究團隊、蛋白質(zhì)組學團隊、干細胞研究團隊、心血管疾病研究團隊等。
研究領(lǐng)域
研究院以國家中長期科技規(guī)劃以及國家、上海市的經(jīng)濟建設和社會發(fā)展設計組織項目申請和團隊建設為出發(fā)點，設立的主要研究方向包括醫(yī)學全在線搜集整,理zxtf.net.cn：代謝和分子細胞生物學、表觀遺傳醫(yī)學和干細胞學、疾病系統(tǒng)生物學和創(chuàng)新藥物和結(jié)構(gòu)生物學、出生缺陷與發(fā)育生物學。
科研經(jīng)費、論文、項目、成果
截至2012年12月生物醫(yī)學研究院全職人員和雙聘人員共申請到國家和地方科研項目批準經(jīng)費額度總計6億元，發(fā)表以復旦大學為第一署名單位的含生物醫(yī)學研究院的SCI論文844余篇。研究論文大部分發(fā)表在跨學科的綜合交叉的頂尖刊物上，包括Cell、Science、 Nat Medicine、 Nat Genetics、 Nature Cell Biol、Cancer Cell、Mol Cell、PNAS以及一級/二級學科的權(quán)威刊物等。2009年至2012年，我院連續(xù)每年均在國際頂尖刊物Cell，Science上以第一作者或通訊作者發(fā)表論文。
國內(nèi)外交流合作
我院共承辦、舉辦國際頂尖國際會議8次，邀請了Lee Hartwell，Tim Hunt，田中耕一，Peter Agre，Kurt Wuetrich教授、Thomas A Steitz等諾貝爾獎獲得者作學術(shù)報告，來訪皇家學會會員、院士等20余人。
發(fā)展目標、愿景
生物醫(yī)學研究院未來要發(fā)展成為世界一流的對重大疾病進行生物醫(yī)學交叉的基地，成為攻克威脅人類重大疾病的科研中心，基礎與臨床、治療與預防等交叉的合作平臺。
