南京中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院前身為南京中醫(yī)學(xué)院中藥系，始建于1960 年，是全國中醫(yī)院校中最早成立的高等中藥學(xué)教學(xué)單位之一。隨著專業(yè)門類的增加和教育事業(yè)的發(fā)展，1995年更名為南京中醫(yī)藥大學(xué)中藥學(xué)院，2000年更名為藥學(xué)院。
藥學(xué)院經(jīng)過40多年的建設(shè)和發(fā)展，在師資隊(duì)伍、辦學(xué)條件、教學(xué)及科研等各方面均取得了較大的發(fā)展。現(xiàn)設(shè)有基礎(chǔ)化學(xué)、藥物分析、藥物化學(xué)、藥理學(xué)、藥用植物學(xué)、中藥鑒定學(xué)、中藥炮制學(xué)、中藥藥劑學(xué)、制藥工程學(xué)、生物制藥學(xué)、臨床藥學(xué)、藥事管理學(xué)十二個(gè)教研室、以及教學(xué)實(shí)驗(yàn)中心、院辦公室和學(xué)生工作辦公室。同時(shí)擁有江蘇省高校基礎(chǔ)課實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心。還設(shè)有藥物研究所、藥用菌及中藥生物技術(shù)研究中心、新藥研究開發(fā)中心及中藥標(biāo)本室。
藥學(xué)院現(xiàn)有在編教職工99名，兼職教師38名，合計(jì)137名。其中教師數(shù)為115名，具有正高職稱的人員23名，占20.00%；副高職稱的人員26名，占22.61%；講師46名，占40.00%。博士學(xué)位24人，20.87%；碩士學(xué)位73人，占63.48%。學(xué)科有博士生導(dǎo)師14名，碩士導(dǎo)師28名。教師中享受國家政府津貼專家4人，國家級(jí)有突出貢獻(xiàn)的中青年專家和全國“百千萬人才”工程第一層次1名，教育部?jī)?yōu)秀教師1名，全國師德先進(jìn)個(gè)人1名，江蘇省有突出貢獻(xiàn)的中青年專家3名，南京市有突出貢獻(xiàn)的中青年專家1名，江蘇省青年科技獎(jiǎng)2名，江蘇省優(yōu)秀科技工作者3名，江蘇省“五一”勞動(dòng)獎(jiǎng)?wù)芦@得者1名，江蘇省、國家新藥審評(píng)專家10人，國家藥典委員會(huì)委員1名。江蘇省“333”人才工程9名，江蘇省“青藍(lán)工程”培養(yǎng)對(duì)象10名。2002、2005年兩次被評(píng)為“江蘇省優(yōu)秀學(xué)科梯隊(duì)”。此外，聘請(qǐng)外籍名譽(yù)教授2名、國內(nèi)客座教授4名。
學(xué)院在先進(jìn)的教育思想觀念指導(dǎo)下，處理好規(guī)模與教學(xué)質(zhì)量的關(guān)系，緊貼行業(yè)發(fā)展需求，適度擴(kuò)大招生規(guī)模，學(xué)院現(xiàn)有本科學(xué)生2200多名，五個(gè)本科專業(yè)（中藥學(xué)、藥學(xué)、制藥工程、藥物制劑、中藥資源與開發(fā))和六個(gè)本科專業(yè)方向（中藥藥理學(xué)、中藥資源與鑒定、臨床藥學(xué)、生物制藥、中藥制藥、食品與藥品監(jiān)測(cè))。到目前為止已培養(yǎng)4000多名高等中藥人才。學(xué)院自1981年始招收國內(nèi)外研究生和進(jìn)修生。現(xiàn)設(shè)有中藥學(xué)博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，中藥學(xué)博士后流動(dòng)站，中藥學(xué)、藥劑學(xué)、生藥學(xué)、中藥藥理學(xué)4個(gè)碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)。至今已有7名博士后出站，授予40名博士學(xué)位，169名碩士學(xué)位，目前高層次人才培養(yǎng)在數(shù)量和質(zhì)量均有較大的提高，在校博士后11名，博士生41名，碩士生177名。此外，還開辦了多期國際中成藥班、碩士學(xué)位課程進(jìn)修班及全國中藥鑒定、中藥炮制、中藥分析師資進(jìn)修班和培訓(xùn)班，執(zhí)業(yè)中藥師繼續(xù)教育培訓(xùn)班、全國中藥房主任繼續(xù)教育學(xué)習(xí)班，接受了數(shù)百名來自國內(nèi)外的專業(yè)進(jìn)修人員。醫(yī)學(xué)全在.線網(wǎng)站zxtf.net.cn
學(xué)科建設(shè)成績(jī)喜人，1994年被江蘇省政府確立為“江蘇省中藥學(xué)與生藥學(xué)重點(diǎn)學(xué)科”（與中國藥科大學(xué)生藥學(xué)科聯(lián)建)，2000年在江蘇省重點(diǎn)學(xué)科終期檢查中獲得優(yōu)秀（A級(jí))等級(jí)。2001年被國家中醫(yī)藥管理局確認(rèn)為“中藥制藥學(xué)重點(diǎn)學(xué)科建設(shè)單位”，在中期檢查中獲優(yōu)秀。2002年中藥學(xué)科被國家教育部確認(rèn)為國家重點(diǎn)學(xué)科。2004年經(jīng)高等學(xué)校與科研院所學(xué)位與研究生教育評(píng)估所評(píng)估，我校中藥學(xué)綜合排名位居全國中藥學(xué)一級(jí)學(xué)科第三，高校第二，成為國內(nèi)外具有影響的重點(diǎn)學(xué)科。其主要課程，中藥炮制學(xué)、中藥鑒定學(xué)被評(píng)為江蘇省一類優(yōu)秀課程，中藥藥劑學(xué)、中藥化學(xué)被評(píng)為江蘇省二類優(yōu)秀課程。
此外，學(xué)院也十分重視科研工作，加大科研實(shí)驗(yàn)室建設(shè)和基礎(chǔ)投入，擁有一批先進(jìn)的儀器設(shè)備，如紅外分光光度計(jì)、紫外分光光度計(jì)、高效液相色譜儀、原子吸收光譜儀、薄層掃描儀、氣相色譜儀、全自動(dòng)生化分析儀、多導(dǎo)生理記錄儀、心腦血管功能測(cè)定儀、熒光顯微鏡、超臨界CO2提取儀等。這些先進(jìn)儀器為藥學(xué)院的教學(xué)和科研提供了良好的基礎(chǔ)條件和先進(jìn)的研究手段，為把藥學(xué)院各學(xué)科的研究推向國際藥學(xué)研究的前沿奠定了良好基礎(chǔ)。醫(yī)學(xué)全在線www.med126.com
近三年來教師主持承擔(dān)的部省級(jí)以上科研課題100項(xiàng)。其中國家級(jí)32項(xiàng)；部省級(jí)12項(xiàng)；廳局級(jí)32項(xiàng)；橫向課題24項(xiàng)。總科研經(jīng)費(fèi)4000多萬元。獲省部級(jí)以上科研成果獎(jiǎng)28項(xiàng)。專利申請(qǐng)18項(xiàng)，其中已授權(quán)的發(fā)明專利8項(xiàng)。銀香顆粒獲新藥證書和藥品批準(zhǔn)文號(hào)；獲藥物臨床批件17項(xiàng)，功能性保健食品證書2項(xiàng)。在《Planta medica》、《Phytochemistry》、《Tetrahedron》、《Journal Natural Products》、《藥學(xué)學(xué)報(bào)》、《中草藥》、《中國中藥雜志》等國內(nèi)外核心期刊上發(fā)表學(xué)術(shù)論文480余篇，其中11篇被SCI收錄。編著出版教材、專著62部(本)。
為了使教學(xué)、科研能與國際接軌，實(shí)現(xiàn)學(xué)校提出的建成“國際著名，國內(nèi)一流”學(xué)校的目標(biāo)，同時(shí)也為提高人才培養(yǎng)質(zhì)量。學(xué)院還與日本國立富山醫(yī)科藥科大學(xué)、熊本大學(xué)、大阪大學(xué)，英國倫敦大學(xué)，加拿大多倫多大學(xué)、美國生物代謝實(shí)驗(yàn)室、北京大學(xué)、清華大學(xué)、浙江大學(xué)、南京大學(xué)等國內(nèi)外大學(xué)和科研機(jī)構(gòu)建立了長(zhǎng)期穩(wěn)定的協(xié)作關(guān)系和教學(xué)科研基地。與全國中藥制藥企業(yè)、研究院所、藥檢所、醫(yī)院等72家單位建立了穩(wěn)定的教學(xué)實(shí)習(xí)基地。教學(xué)、科研和科技成果轉(zhuǎn)化總體實(shí)力位居全國同類院校前列。近三年來，學(xué)生的科研、實(shí)踐能力也得到了充分鍛煉和提高，在學(xué)校舉行的“大學(xué)生科技創(chuàng)新大賽”中，藥學(xué)院連續(xù)三年奪得校“科創(chuàng)杯”，2005年“中藥ST納米球的研制”作品代表江蘇省進(jìn)入全國大學(xué)生“挑戰(zhàn)杯”比賽，實(shí)現(xiàn)了我校歷史上該項(xiàng)目“零”的突破。近三年來共發(fā)展學(xué)生黨員98名，應(yīng)屆畢業(yè)生考研錄取率達(dá)到20%以上，就業(yè)率99%以上。
展望未來，藥學(xué)院將保持適度招生規(guī)模，緊貼行業(yè)需求，適時(shí)調(diào)整部分專業(yè)方向，加強(qiáng)內(nèi)涵建設(shè)，提高管理水平，將學(xué)院建設(shè)成藥學(xué)類學(xué)科、專業(yè)齊全，師資力量雄厚，教學(xué)科研成果均居國內(nèi)同類院系前列的一流教學(xué)研究型學(xué)院。
