復(fù)旦大學(xué)藥學(xué)院（原上海醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院）成立于1936年，是我國(guó)辦學(xué)歷史悠久、學(xué)科齊全、師資力量雄厚的藥學(xué)院之一。成立初期稱為國(guó)立上海醫(yī)學(xué)院藥學(xué)專修科，之后歷經(jīng)多次更名，分別為國(guó)立上海醫(yī)學(xué)院藥科、國(guó)立上海醫(yī)學(xué)院藥學(xué)院、上海第一醫(yī)學(xué)院藥學(xué)系、上海醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院。2000年4月，原上海醫(yī)科大學(xué)與原復(fù)旦大學(xué)合并，遂更名為復(fù)旦大學(xué)藥學(xué)院。現(xiàn)任院長(zhǎng)為朱依諄教授。
復(fù)旦大學(xué)藥學(xué)院為全國(guó)醫(yī)藥教育學(xué)會(huì)藥學(xué)教育研究會(huì)副理事長(zhǎng)單位。學(xué)院下設(shè)藥物化學(xué)、天然藥物化學(xué)、生物合成藥物化學(xué)、生藥學(xué)、藥劑學(xué)、藥理學(xué)、醫(yī)院藥學(xué)、藥物分析化學(xué)、放射藥學(xué)、生物化學(xué)和物理化學(xué)等11個(gè)教研室和1個(gè)藥用化學(xué)綜合實(shí)驗(yàn)室，藥學(xué)研究所和《中國(guó)臨床藥學(xué)雜志》社各1個(gè)，還擁有1個(gè)衛(wèi)生部上海市臨床藥學(xué)培訓(xùn)中心。現(xiàn)有教職員工107人，其中教授（含研究員、主任技師）22人，副教授（含副研究員、副主任技師）23人。 學(xué)院具有藥學(xué)一級(jí)學(xué)科博士學(xué)位授予權(quán)，擁有藥學(xué)一級(jí)學(xué)科博士后流動(dòng)站1個(gè)、二級(jí)學(xué)科博士點(diǎn)5個(gè)（藥劑學(xué)、藥物化學(xué)、藥理學(xué)、生藥學(xué)和生物化學(xué)）、二級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)6個(gè)（藥劑學(xué)、藥物化學(xué)、藥理學(xué)、生藥學(xué)、生物化學(xué)和藥物分析）。藥學(xué)一級(jí)學(xué)科曾被列為上海市“重中之重”建設(shè)學(xué)科和復(fù)旦大學(xué)“985”重點(diǎn)建設(shè)學(xué)科，藥物化學(xué)也是上海市教委重點(diǎn)學(xué)科。藥學(xué)院與復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院聯(lián)合設(shè)立了“國(guó)家生命科學(xué)與技術(shù)人才培養(yǎng)基地—生物醫(yī)藥點(diǎn)”。
近年來(lái)，藥學(xué)院在教學(xué)、科研和新藥研發(fā)領(lǐng)域均取得了一定的成果。重點(diǎn)開(kāi)展了心血管及神經(jīng)系統(tǒng)疾病的藥物以及抗腫瘤、抗病毒（乙肝和艾滋病毒）藥物和新型給藥系統(tǒng)的研究，形成了新藥研究的特色領(lǐng)域，并與國(guó)內(nèi)外相關(guān)機(jī)構(gòu)建立了廣泛的科研合作關(guān)系。不久，藥學(xué)院將整體搬遷張江藥谷，學(xué)院的各項(xiàng)建設(shè)又將步入一個(gè)全新的快速發(fā)展階段，學(xué)院面臨著再次騰飛的良機(jī)！