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通過(guò)檢測(cè)人類(lèi)T細(xì)胞受體TCR基因在治療前后的變化來(lái)評(píng)價(jià)治療HIV藥物療效的方法

公開(kāi)(公告)號(hào) CN1253584C  
公開(kāi)(公告)日 2006.04.26  
申請(qǐng)(專(zhuān)利)號(hào) CN02131070.X  
申請(qǐng)日期 2002.09.28  
專(zhuān)利名稱(chēng) 通過(guò)檢測(cè)人類(lèi)T細(xì)胞受體TCR基因在治療前后的變化來(lái)評(píng)價(jià)治療HIV藥物療效的方法  
主分類(lèi)號(hào) C12Q1/68(2006.01)I  
分類(lèi)號(hào) C12Q1/68(2006.01)I  
分案原申請(qǐng)?zhí)?  
優(yōu)先權(quán)  
申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人 北京佰仁思生物工程有限責(zé)任公司  
發(fā)明(設(shè)計(jì))人 寇忠琛  
地址 102200北京市海淀區(qū)中關(guān)村科技園區(qū)昌平園星火街6號(hào)  
頒證日  
國(guó)際申請(qǐng)  
進(jìn)入國(guó)家日期  
專(zhuān)利代理機(jī)構(gòu) 北京匯澤知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司  
代理人 張若華  
國(guó)省代碼 北京;11  
主權(quán)項(xiàng) 通過(guò)檢測(cè)人類(lèi)T細(xì)胞受體TCR基因在治療前后的變化來(lái)評(píng)價(jià)治療HIV藥物療效的方法,其步驟為:a.血樣經(jīng)采集分離后,得到外周血單個(gè)核細(xì)胞,再進(jìn)一步分離出CD4或CD8T細(xì)胞;b.分離和提純出T細(xì)胞的mRNA后,通過(guò)mRNA合成得到cDNA;c.在極其靠近CDR3區(qū)段V基因區(qū)設(shè)計(jì)22個(gè)內(nèi)側(cè)Vβ基因引物和一個(gè)內(nèi)側(cè)Cβ基因引物,Cβ基因引物的5′端插入七個(gè)非模板堿基GTTTCTT,Cβ基因引物采用高靈敏度的熒光標(biāo)記,所述Vβ基因引物和Cβ基因引物如下:VβoutPCR引物:Vβ1out5′GGAGTCACACAAACCCCAAAGCACCTG3′,Vβ2out5′GTTATCTGTAAGAGTGGAACC3′,Vβ3out5′CTCGTAGATGTGAAAGTAACCCAGAG3′,Vβ4out5′GATAGCCAAGTCACCATGATGTTC3′,Vβ5.1out5′GTCGATTCTCAGGGCGCCAGTTCTC3′,Vβ6out5′GAGTCTCCCAGAACCCCAGACACAAG3′,Vβ7out5′GGTCATGGGAATGACAAATAAGAAG3′,Vβ8out5′CGATAGATGATTCAGGGATGCCCGAG3′,Vβ9out5′GACAAGTCCATTAAATGTGAAC3′,Vβ11out5′CTGACATCTACCAGACCCCAAGATAC3′,Vβ12out5′GATACTGACAAAGGAGAAGTC3′,Vβ13out5′CAAGACCCAGGCATGGGGCTGAAG3′,Vβ14out5′GGGAGATGTTCCTGAAGGGTAC3′,Vβ15out5′CTCGACAGGCACAGGCTAAATTC3′,Vβ16out5′GATTCTTAGCTGAAAGGACTGGAGG3′,Vβ17out5′GAAGGGTACAGCGTCTCTCGGGAGAAG3′,Vβ18out5′GCCGGCGTCATGCAGAACCCAAGAC3′,Vβ20out5′CTCTCAGCCTCCAGACCCCAG3′,Vβ21out5′GCCTGTGGCTTTTTGGTGCAATC3′,Vβ22out5′CACACAGATGGGACAGGAAG3′,Vβ23out5′CCCTGATCGATTCTCAGCTCAAC3′,Vβ24out5′CGGCCGAACACTTCTTTCTG3′;VβinPCR引物:Vβ1in5′CTAAACCTGAGCTCTCTGG3′,Vβ2in5′GCAGCTTCTACATCTGCAG3′,Vβ3in5′GATTCTGGAGTCCGCCAG3′,Vβ4in5′CAGCAGCATATATCTCTGC3′,Vβ5.1in5′GACTCGGCCCTTTATCTTTG3′,Vβ6in5′GGAGATCCAGCGCACAGAG3′,Vβ7in5′CCTGAATGCCCCAACAGCTC3′,Vβ8in5′CCAGCCCTCAGAACCCAGG3′,Vβ9in5′CTGGAGCTTGGTGACTCTGTG3′,Vβ11in5′CCTGGAGTCTGCCAGGCC3′,Vβ12in5′CTCACTCTGGAGTCGCTAC3′,Vβ13in5′GAGGATTTCCCGCTCAGGC3′,Vβ14in5′GAGAAGAGGAATTTCAATTTCC3′,Vβ15in5′GAGTCTGCCATCCCCAAC3′,Vβ16in5′CAGAACTGGAGGATTCTGG3′,Vβ17in5′CGGCCCAAAAGAACCCGACAGC3′,Vβ18in5′GTGCGAGGAGATTCGGCAG3′,Vβ20in5′CAGGACCGGCAGTTCATCTTC3′,Vβ21in5′CCTGCAGAGCTTGGGGAC3′,Vβ22in5′CACTCTGAAGATCCGGTCC3′,Vβ23in5′GAGCTCCTTGGAGCTGGGG3′,Vβ24in5′CATCCGCTCACCAGGCCTGGG3′;Cβout5′CAGGCCTCGGCGCTGACGATCTGGGTGAC3′,3′Cβin*5′GTTTCTTGATCTCTGCTTCTGATGGCTCAAAC3′,*6-FAMlabelling;d.將設(shè)計(jì)的引物和由mRNA合成的cDNA通過(guò)兩次PCR反應(yīng)來(lái)擴(kuò)增cDNA,所述兩次PCR反應(yīng)的條件為:第一次反應(yīng):變性95℃,45秒;復(fù)性60℃,45秒;延伸72℃,45秒,34個(gè)循環(huán),72℃10分鐘;反應(yīng)體系為:5′引物10pmol1μl,3′引物10pmol1μl,dNTPs10mM1μl,10×反應(yīng)緩沖液2.5μl,三蒸水18.75μl,cDNA0.5μl,TaqDNA聚合酶0.25μl;第二次反應(yīng):變性95℃,30秒;復(fù)性60℃,30秒;延伸72℃,30秒,15個(gè)循環(huán),72℃10分鐘;反應(yīng)體系為:5′引物10pmol0.5μl,3′引物10pmol0.5μl,dNTPs10mM1μl,10×反應(yīng)緩沖液2.5μl,三蒸水19.75μl,第一次PCR產(chǎn)物0.5μl,TaqDNA聚合酶0.25μl;其中10×反應(yīng)緩沖液的組分如下:Tris-HClpH8.3300mM,MgCl250mM,KCl25mM,明膠0.01%;e.將經(jīng)過(guò)兩次PCR反應(yīng)擴(kuò)增并被熒光標(biāo)記的T細(xì)胞受體基因,與甲酰胺混合后94℃變性,將變性產(chǎn)物置于含6%丙烯酰胺的測(cè)序凝膠中,在DNA測(cè)序機(jī)上運(yùn)行,得到的數(shù)據(jù)用ABIPRISMGeneScan分析軟件進(jìn)行分析和量化,通過(guò)比較HIV病毒感染者治療前后CDR3基因圖譜的變化,得出藥物療效的評(píng)價(jià)結(jié)果。  
摘要 發(fā)明提供一種通過(guò)設(shè)計(jì)的特定引物來(lái)完成PCR反應(yīng),放大感染HIV病毒的患者的T細(xì)胞受體TCR基因在接受藥物治療前后的變化,進(jìn)而評(píng)價(jià)藥物的療效的方法,本發(fā)明提供的技術(shù)不但填補(bǔ)了技術(shù)上的空白而且具有靈敏度高,準(zhǔn)確性好的優(yōu)點(diǎn)。  
國(guó)際公布  
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